RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 PHKBQ93100 1093 aa21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.12■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 KIF28PB7ZC32 967 aa21.12■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 CCDC192P0DO97 292 aa21.12■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 DOK7Q18PE1 504 aa21.12■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.12■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.12■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 ZBTB43O43298 467 aa21.11■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.11■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.11■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 SNED1Q8TER0 1413 aa21.11■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.11■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.11■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 TYRO3Q06418 890 aa21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 PPARAQ07869 468 aa21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 KRT23Q9C075 422 aa21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 NTRK3Q16288 839 aa21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 HS1BP3Q53T59 392 aa21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 ALG1Q9BT22 464 aa21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 CLIC4Q9Y696 253 aa21.1■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.09■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 LIFRP42702 1097 aa21.09■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 AOC3Q16853 763 aa21.09■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 ATL3Q6DD88 541 aa21.09■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.09■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.09■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 ME1P48163 572 aa21.08■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.08■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 CCDC69A6NI79 296 aa21.08■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 AP5Z1O43299 807 aa21.08■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 CCDC93Q567U6 631 aa21.08■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.08■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 CD209Q9NNX6 404 aa21.08■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.08■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.08■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 ADCY5O95622 1261 aa21.07■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 SYT17Q9BSW7 474 aa21.07■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 CDKL5O76039 1030 aa21.07■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.07■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.07■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 MECOMQ03112 1051 aa21.06■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.06■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 FBXW7Q969H0 707 aa21.06■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 PRDX5P30044 214 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 PLCB2Q00722 1185 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 EVX2Q03828 476 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 WTAPQ15007 396 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 KRT40Q6A162 431 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 GRIK5Q16478 980 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 BRAPQ7Z569 592 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 FSIP1Q8NA03 581 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 MXD3Q9BW11 206 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.05■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 SEMA3EO15041 775 aa21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 LUZP1Q86V48 1076 aa21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 COL4A5P29400 1685 aa21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 PPIP5K2O43314 1243 aa21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 RASSF7Q02833 373 aa21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 STK38Q15208 465 aa21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.04■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 G3V3G9 751 aa21.03■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.03■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.03■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms