RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnk13Q8R1P5 405 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Syt10Q9R0N4 523 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 GalcP54818 684 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc51Q3URS9 406 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ehmt1Q5DW34 1296 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc27a1Q60714 646 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp7b1Q60991 507 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnj14Q8JZN3 434 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc14a2Q8R4T9 930 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tlr8P58682 1032 aa17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmtc2Q56A06 836 aa17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nyap1Q6PFX7 833 aa17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NfixP70257 488 aa17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp4cP97470 307 aa17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ces1hD3Z298 562 aa17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spg7Q3ULF4 781 aa17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mum1l1Q4VA55 681 aa17.23■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm3893E9Q1I1 302 aa17.22■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cypt2Q6P924 180 aa17.22■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem179Q8BHH9 233 aa17.22■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cep89Q9CZX2 791 aa17.22■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prr16A3KMN5 304 aa17.22■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gse1Q3U3C9 1213 aa17.22■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr119Q7TRJ5 321 aa17.22■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nrbp1Q99J45 535 aa17.22■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Snapc4Q8BP86 1333 aa17.22■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa17.21■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NcapgE9PWG6 1004 aa17.21■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Psd3Q2PFD7 1037 aa17.21■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Large1Q9Z1M7 756 aa17.21■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pcsk7Q61139 770 aa17.21■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vnn1Q9Z0K8 512 aa17.21■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa17.21■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ambra1A2AH22 1300 aa17.21■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igsf9bE9PZ19 1328 aa17.21■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa17.21■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem87aQ8BXN9 555 aa17.21■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trim11Q99PQ2 467 aa17.21■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 UvssaQ9D479 717 aa17.21■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdcp1Q5U462 833 aa17.2■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RadxQ8C779 850 aa17.2■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NsmfQ99NF2 532 aa17.2■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AllcQ9JHX6 414 aa17.2■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stxbp4Q9WV89 557 aa17.2■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Grin2dQ03391 1323 aa17.2■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankrd1Q9CR42 319 aa17.2■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dctpp1Q9QY93 170 aa17.2■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zscan20B2KFW1 1030 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ftl1P29391 183 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cep131Q62036 1060 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp4x1Q6A152 507 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Clec16aQ80U30 1036 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 StrcQ8VIM6 1809 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 UncxO08934 530 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc7a1Q09143 622 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Traf3ip1Q149C2 625 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pet2A2AHY8 747 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dapk3O54784 448 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slurp2P0DP59 97 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Grin1P35438 938 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpusd2Q149F1 553 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp13Q5BKP2 858 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa17.19■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Amer1Q7TS75 1132 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Uba5Q8VE47 403 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MbipQ99LQ1 341 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb21E9Q444 1094 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nmt2O70311 529 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Best3Q6H1V1 669 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nek3Q9R0A5 511 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TicrrQ8BQ33 1889 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ecm29Q6PDI5 1840 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ehd2Q8BH64 543 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ubac1Q8VDI7 409 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ripk4Q9ERK0 786 aa17.18■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zkscan4Q5SZT6 480 aa17.17■□□□□ 0.34
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LrmpQ60664 539 aa17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19 ms