RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 MT1HP80294 61 aa3.66□□□□□ -1.82
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
CTXN3-204ENST00000620385 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.66□□□□□ -1.82
CTXN3-204ENST00000620385 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.64□□□□□ -1.83
CTXN3-204ENST00000620385 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.63□□□□□ -1.83
CTXN3-204ENST00000620385 PP632Q6XCG6 107 aa3.6□□□□□ -1.83
CTXN3-204ENST00000620385 PLAC4Q8WY50 150 aa3.57□□□□□ -1.84
CTXN3-204ENST00000620385 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.55□□□□□ -1.84
CTXN3-204ENST00000620385 MT2AP02795 61 aa3.55□□□□□ -1.84
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP10-10P60014 251 aa3.54□□□□□ -1.84
CTXN3-204ENST00000620385 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.53□□□□□ -1.84
CTXN3-204ENST00000620385 MT1FP04733 61 aa3.52□□□□□ -1.85
CTXN3-204ENST00000620385 TNP1P09430 55 aa3.52□□□□□ -1.85
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.51□□□□□ -1.85
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP5-8O75690 187 aa3.48□□□□□ -1.85
CTXN3-204ENST00000620385 LCE1CQ5T751 118 aa3.47□□□□□ -1.85
CTXN3-204ENST00000620385 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.47□□□□□ -1.85
CTXN3-204ENST00000620385 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.42□□□□□ -1.86
CTXN3-204ENST00000620385 MT1BP07438 61 aa3.38□□□□□ -1.87
CTXN3-204ENST00000620385 MT1XP80297 61 aa3.31□□□□□ -1.88
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.26□□□□□ -1.89
CTXN3-204ENST00000620385 LUZP6Q538Z0 58 aa3.2□□□□□ -1.9
CTXN3-204ENST00000620385 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.17□□□□□ -1.9
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP12-3P60328 96 aa3.15□□□□□ -1.91
CTXN3-204ENST00000620385 USH2AO75445 5202 aa3.14□□□□□ -1.91
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.11□□□□□ -1.91
CTXN3-204ENST00000620385 SSPOA2VEC9 5147 aa3.11□□□□□ -1.91
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3□□□□□ -1.93
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.95□□□□□ -1.94
CTXN3-204ENST00000620385 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.94□□□□□ -1.94
CTXN3-204ENST00000620385 MT1EP04732 61 aa2.91□□□□□ -1.94
CTXN3-204ENST00000620385 MT1LQ93083 61 aa2.88□□□□□ -1.95
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.86□□□□□ -1.95
CTXN3-204ENST00000620385 KMT2DO14686 5537 aa2.84□□□□□ -1.96
CTXN3-204ENST00000620385 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
CTXN3-204ENST00000620385 MT1GP13640 62 aa2.8□□□□□ -1.96
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.8□□□□□ -1.96
CTXN3-204ENST00000620385 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.8□□□□□ -1.96
CTXN3-204ENST00000620385 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.75□□□□□ -1.97
CTXN3-204ENST00000620385 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.75□□□□□ -1.97
CTXN3-204ENST00000620385 MT1MQ8N339 61 aa2.73□□□□□ -1.97
CTXN3-204ENST00000620385 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.73□□□□□ -1.97
CTXN3-204ENST00000620385 INE1O15225 51 aa2.72□□□□□ -1.97
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.66□□□□□ -1.98
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.66□□□□□ -1.98
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.66□□□□□ -1.98
CTXN3-204ENST00000620385 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
CTXN3-204ENST00000620385 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.63□□□□□ -1.99
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.57□□□□□ -2
CTXN3-204ENST00000620385 SPRR2EP22531 72 aa2.56□□□□□ -2
CTXN3-204ENST00000620385 SPRR2BP35325 72 aa2.56□□□□□ -2
CTXN3-204ENST00000620385 SPRR2AP35326 72 aa2.56□□□□□ -2
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.55□□□□□ -2
CTXN3-204ENST00000620385 MDN1Q9NU22 5596 aa2.54□□□□□ -2
CTXN3-204ENST00000620385 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.52□□□□□ -2.01
CTXN3-204ENST00000620385 MT1AP04731 61 aa2.48□□□□□ -2.01
CTXN3-204ENST00000620385 SPRR2DP22532 72 aa2.47□□□□□ -2.01
CTXN3-204ENST00000620385 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CTXN3-204ENST00000620385 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.37□□□□□ -2.03
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP12-4P60329 112 aa2.29□□□□□ -2.04
CTXN3-204ENST00000620385 NEBP20929 6669 aa2.26□□□□□ -2.05
CTXN3-204ENST00000620385 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.17□□□□□ -2.06
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.13□□□□□ -2.07
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.12□□□□□ -2.07
CTXN3-204ENST00000620385 MT4P47944 62 aa2.06□□□□□ -2.08
CTXN3-204ENST00000620385 PRM1P04553 51 aa1.95□□□□□ -2.1
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.82□□□□□ -2.12
CTXN3-204ENST00000620385 MUC5ACP98088 5654 aa1.79□□□□□ -2.12
CTXN3-204ENST00000620385 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.73□□□□□ -2.13
CTXN3-204ENST00000620385 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.67□□□□□ -2.14
CTXN3-204ENST00000620385 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
CTXN3-204ENST00000620385 PHGR1C9JFL3 82 aa1.34□□□□□ -2.19
CTXN3-204ENST00000620385 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.26□□□□□ -2.21
CTXN3-204ENST00000620385 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 399.7 ms