RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568631.5

RNPS1-223, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-223	ENST00000568631	NEB	P20929	6669 aa		5.91	□□□□□ -1.46
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.85	□□□□□ -1.47
RNPS1-223	ENST00000568631	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RNPS1-223	ENST00000568631	MT1L	Q93083	61 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RNPS1-223	ENST00000568631	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RNPS1-223	ENST00000568631	SPRR2E	P22531	72 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RNPS1-223	ENST00000568631	SPRR2B	P35325	72 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RNPS1-223	ENST00000568631	SPRR2A	P35326	72 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RNPS1-223	ENST00000568631	MT1G	P13640	62 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RNPS1-223	ENST00000568631	MT1M	Q8N339	61 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RNPS1-223	ENST00000568631	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.55	□□□□□ -1.52
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.53	□□□□□ -1.52
RNPS1-223	ENST00000568631	NDUFAF8	A1L188	74 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNPS1-223	ENST00000568631	SPRR2D	P22532	72 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RNPS1-223	ENST00000568631	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RNPS1-223	ENST00000568631	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNPS1-223	ENST00000568631	MT1A	P04731	61 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNPS1-223	ENST00000568631	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RNPS1-223	ENST00000568631	MT4	P47944	62 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RNPS1-223	ENST00000568631	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RNPS1-223	ENST00000568631	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNPS1-223	ENST00000568631	INE1	O15225	51 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RNPS1-223	ENST00000568631	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RNPS1-223	ENST00000568631	MT3	P25713	68 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RNPS1-223	ENST00000568631	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RNPS1-223	ENST00000568631	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RNPS1-223	ENST00000568631	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RNPS1-223	ENST00000568631	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RNPS1-223	ENST00000568631	PRM1	P04553	51 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RNPS1-223	ENST00000568631	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RNPS1-223	ENST00000568631	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RNPS1-223	ENST00000568631	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.4	□□□□□ -2.03
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.19	□□□□□ -2.06
RNPS1-223	ENST00000568631	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.79	□□□□□ -2.12

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