RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567542.5

PRMT7-223, Transcript of protein arginine methyltransferase 7, human

TSL 1 (best)

Gene PRMT7, Length 3,542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PRMT7-223	ENST00000567542	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
PRMT7-223	ENST00000567542	MT1E	P04732	61 aa		4.4	□□□□□ -1.7
PRMT7-223	ENST00000567542	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PRMT7-223	ENST00000567542	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PRMT7-223	ENST00000567542	MT1L	Q93083	61 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRMT7-223	ENST00000567542	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.33	□□□□□ -1.72
PRMT7-223	ENST00000567542	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.32	□□□□□ -1.72
PRMT7-223	ENST00000567542	MT1G	P13640	62 aa		4.31	□□□□□ -1.72
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.29	□□□□□ -1.72
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PRMT7-223	ENST00000567542	MT1M	Q8N339	61 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRMT7-223	ENST00000567542	SPRR2E	P22531	72 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PRMT7-223	ENST00000567542	SPRR2B	P35325	72 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PRMT7-223	ENST00000567542	SPRR2A	P35326	72 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4	□□□□□ -1.77
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.84	□□□□□ -1.8
PRMT7-223	ENST00000567542	SPRR2D	P22532	72 aa		3.83	□□□□□ -1.8
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PRMT7-223	ENST00000567542	PRM1	P04553	51 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PRMT7-223	ENST00000567542	MT1A	P04731	61 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PRMT7-223	ENST00000567542	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PRMT7-223	ENST00000567542	MT4	P47944	62 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PRMT7-223	ENST00000567542	NEB	P20929	6669 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PRMT7-223	ENST00000567542	MT3	P25713	68 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PRMT7-223	ENST00000567542	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PRMT7-223	ENST00000567542	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PRMT7-223	ENST00000567542	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PRMT7-223	ENST00000567542	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.57	□□□□□ -2
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.56	□□□□□ -2
PRMT7-223	ENST00000567542	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.5	□□□□□ -2.01
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.5	□□□□□ -2.01
PRMT7-223	ENST00000567542	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.48	□□□□□ -2.01
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.47	□□□□□ -2.01
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.34	□□□□□ -2.03
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.3	□□□□□ -2.04
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.2	□□□□□ -2.06
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.18	□□□□□ -2.06
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.13	□□□□□ -2.07
PRMT7-223	ENST00000567542	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.12	□□□□□ -2.07
PRMT7-223	ENST00000567542	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.06	□□□□□ -2.08
PRMT7-223	ENST00000567542	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.88	□□□□□ -2.11
PRMT7-223	ENST00000567542	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.2	□□□□□ -2.22

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