RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 COA5Q86WW8 74 aa2.3□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 H0Y9P7 68 aa2.28□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.27□□□□□ -2.05
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TMOD3-208ENST00000560725 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-208ENST00000560725 A6NN06 94 aa2.22□□□□□ -2.05
TMOD3-208ENST00000560725 Q5VV11 94 aa2.22□□□□□ -2.05
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.22□□□□□ -2.05
TMOD3-208ENST00000560725 DMAC1Q96GE9 116 aa2.22□□□□□ -2.05
TMOD3-208ENST00000560725 CSAG1Q6PB30 78 aa2.21□□□□□ -2.06
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-208ENST00000560725 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-208ENST00000560725 ACYP2P14621 99 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-208ENST00000560725 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-208ENST00000560725 S4R3F8 94 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-208ENST00000560725 MT1BP07438 61 aa2.17□□□□□ -2.06
TMOD3-208ENST00000560725 CRIPTQ9P021 101 aa2.17□□□□□ -2.06
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TMOD3-208ENST00000560725 ROMO1P60602 79 aa2.16□□□□□ -2.06
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.16□□□□□ -2.06
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TMOD3-208ENST00000560725 PRR15LQ9BU68 103 aa2.15□□□□□ -2.07
TMOD3-208ENST00000560725 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.13□□□□□ -2.07
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.12□□□□□ -2.07
TMOD3-208ENST00000560725 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.12□□□□□ -2.07
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.11□□□□□ -2.07
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.11□□□□□ -2.07
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.11□□□□□ -2.07
TMOD3-208ENST00000560725 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.09□□□□□ -2.07
TMOD3-208ENST00000560725 H0YAA0 97 aa2.09□□□□□ -2.07
TMOD3-208ENST00000560725 UQCR11O14957 56 aa2.09□□□□□ -2.07
TMOD3-208ENST00000560725 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.09□□□□□ -2.07
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1B0GU69 56 aa2.08□□□□□ -2.08
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TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.04□□□□□ -2.08
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TMOD3-208ENST00000560725 MDN1Q9NU22 5596 aa2□□□□□ -2.09
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TMOD3-208ENST00000560725 M0QZ58 72 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-208ENST00000560725 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.95□□□□□ -2.1
TMOD3-208ENST00000560725 INE1O15225 51 aa1.87□□□□□ -2.11
TMOD3-208ENST00000560725 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.83□□□□□ -2.12
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP5-8O75690 187 aa1.83□□□□□ -2.12
TMOD3-208ENST00000560725 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.82□□□□□ -2.12
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa1.81□□□□□ -2.12
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TMOD3-208ENST00000560725 MT1GP13640 62 aa1.79□□□□□ -2.12
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0D9SG42 100 aa1.78□□□□□ -2.12
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TMOD3-208ENST00000560725 C10orf95Q9H7T3 257 aa1.72□□□□□ -2.13
TMOD3-208ENST00000560725 MT1LQ93083 61 aa1.71□□□□□ -2.14
TMOD3-208ENST00000560725 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
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TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.68□□□□□ -2.14
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.6□□□□□ -2.15
TMOD3-208ENST00000560725 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
TMOD3-208ENST00000560725 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-208ENST00000560725 MT1AP04731 61 aa1.46□□□□□ -2.18
TMOD3-208ENST00000560725 MUC5ACP98088 5654 aa1.44□□□□□ -2.18
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.43□□□□□ -2.18
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD3-208ENST00000560725 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.01□□□□□ -2.25
TMOD3-208ENST00000560725 PHGR1C9JFL3 82 aa0.99□□□□□ -2.25
TMOD3-208ENST00000560725 PRM1P04553 51 aa0.96□□□□□ -2.26
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.79□□□□□ -2.28
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