RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LETMD1-223	ENST00000550442	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-223	ENST00000550442	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-223	ENST00000550442		H3BS24	57 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-223	ENST00000550442	MT1B	P07438	61 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LETMD1-223	ENST00000550442	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LETMD1-223	ENST00000550442	MT1X	P80297	61 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LETMD1-223	ENST00000550442	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LETMD1-223	ENST00000550442	SPRR2E	P22531	72 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LETMD1-223	ENST00000550442	SPRR2B	P35325	72 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LETMD1-223	ENST00000550442	SPRR2A	P35326	72 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LETMD1-223	ENST00000550442	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-223	ENST00000550442	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-223	ENST00000550442	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-223	ENST00000550442	SPRR2D	P22532	72 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LETMD1-223	ENST00000550442	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A0A0MQY5	61 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LETMD1-223	ENST00000550442	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LETMD1-223	ENST00000550442	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.32	□□□□□ -1.72
LETMD1-223	ENST00000550442	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LETMD1-223	ENST00000550442	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LETMD1-223	ENST00000550442	INE1	O15225	51 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LETMD1-223	ENST00000550442	MT1E	P04732	61 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LETMD1-223	ENST00000550442	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LETMD1-223	ENST00000550442	MT1L	Q93083	61 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LETMD1-223	ENST00000550442	MT1G	P13640	62 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LETMD1-223	ENST00000550442	MT4	P47944	62 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.92	□□□□□ -1.78
LETMD1-223	ENST00000550442	MT1M	Q8N339	61 aa		3.89	□□□□□ -1.79
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.63	□□□□□ -1.83
LETMD1-223	ENST00000550442	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LETMD1-223	ENST00000550442	MT1A	P04731	61 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LETMD1-223	ENST00000550442	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LETMD1-223	ENST00000550442	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.85
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.46	□□□□□ -1.86
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LETMD1-223	ENST00000550442	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LETMD1-223	ENST00000550442	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LETMD1-223	ENST00000550442	MT3	P25713	68 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LETMD1-223	ENST00000550442	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.19	□□□□□ -1.9
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.18	□□□□□ -1.9
LETMD1-223	ENST00000550442	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.96	□□□□□ -1.94
LETMD1-223	ENST00000550442	PRM1	P04553	51 aa		2.9	□□□□□ -1.95
LETMD1-223	ENST00000550442	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LETMD1-223	ENST00000550442	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.6	□□□□□ -1.99
LETMD1-223	ENST00000550442	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.6	□□□□□ -1.99
LETMD1-223	ENST00000550442	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.52	□□□□□ -2.01
LETMD1-223	ENST00000550442	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.47	□□□□□ -2.01
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.26	□□□□□ -2.05
LETMD1-223	ENST00000550442	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.96	□□□□□ -2.1
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.91	□□□□□ -2.1
LETMD1-223	ENST00000550442	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.38	□□□□□ -2.19

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.1 ms