RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.12□□□□□ -1.43
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.11□□□□□ -1.43
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
TSNARE1-204ENST00000519651 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.05□□□□□ -1.44
TSNARE1-204ENST00000519651 SPRR2FQ96RM1 72 aa6□□□□□ -1.45
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.97□□□□□ -1.45
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.97□□□□□ -1.45
TSNARE1-204ENST00000519651 MT1GP13640 62 aa5.93□□□□□ -1.46
TSNARE1-204ENST00000519651 MT1MQ8N339 61 aa5.88□□□□□ -1.47
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.87□□□□□ -1.47
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.86□□□□□ -1.47
TSNARE1-204ENST00000519651 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.83□□□□□ -1.48
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.78□□□□□ -1.48
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP5-9P26371 169 aa5.77□□□□□ -1.49
TSNARE1-204ENST00000519651 MDN1Q9NU22 5596 aa5.74□□□□□ -1.49
TSNARE1-204ENST00000519651 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.72□□□□□ -1.49
TSNARE1-204ENST00000519651 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TSNARE1-204ENST00000519651 INE1O15225 51 aa5.7□□□□□ -1.5
TSNARE1-204ENST00000519651 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.66□□□□□ -1.5
TSNARE1-204ENST00000519651 SPRR2EP22531 72 aa5.6□□□□□ -1.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SPRR2BP35325 72 aa5.6□□□□□ -1.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SPRR2AP35326 72 aa5.6□□□□□ -1.51
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.59□□□□□ -1.52
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.59□□□□□ -1.52
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.59□□□□□ -1.52
TSNARE1-204ENST00000519651 NEBP20929 6669 aa5.54□□□□□ -1.52
TSNARE1-204ENST00000519651 SPRR2DP22532 72 aa5.38□□□□□ -1.55
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.23□□□□□ -1.57
TSNARE1-204ENST00000519651 MT1AP04731 61 aa5.22□□□□□ -1.57
TSNARE1-204ENST00000519651 LCE3BQ5TA77 95 aa5.17□□□□□ -1.58
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.14□□□□□ -1.59
TSNARE1-204ENST00000519651 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5□□□□□ -1.61
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.96□□□□□ -1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.96□□□□□ -1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.87□□□□□ -1.63
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP12-4P60329 112 aa4.86□□□□□ -1.63
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.78□□□□□ -1.64
TSNARE1-204ENST00000519651 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.77□□□□□ -1.65
TSNARE1-204ENST00000519651 MT3P25713 68 aa4.74□□□□□ -1.65
TSNARE1-204ENST00000519651 MT4P47944 62 aa4.72□□□□□ -1.65
TSNARE1-204ENST00000519651 LCE4AQ5TA78 99 aa4.72□□□□□ -1.65
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.7□□□□□ -1.66
TSNARE1-204ENST00000519651 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.66□□□□□ -1.66
TSNARE1-204ENST00000519651 LCE1DQ5T752 114 aa4.63□□□□□ -1.67
TSNARE1-204ENST00000519651 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.6□□□□□ -1.67
TSNARE1-204ENST00000519651 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.58□□□□□ -1.68
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.58□□□□□ -1.68
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.46□□□□□ -1.7
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.38□□□□□ -1.71
TSNARE1-204ENST00000519651 PRM1P04553 51 aa4.22□□□□□ -1.73
TSNARE1-204ENST00000519651 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.19□□□□□ -1.74
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.03□□□□□ -1.76
TSNARE1-204ENST00000519651 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.02□□□□□ -1.77
TSNARE1-204ENST00000519651 LCE1EQ5T753 118 aa4.01□□□□□ -1.77
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.93□□□□□ -1.78
TSNARE1-204ENST00000519651 MUC5ACP98088 5654 aa3.88□□□□□ -1.79
TSNARE1-204ENST00000519651 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.88□□□□□ -1.79
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.85□□□□□ -1.79
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP5-8O75690 187 aa3.8□□□□□ -1.8
TSNARE1-204ENST00000519651 LCE1CQ5T751 118 aa3.76□□□□□ -1.81
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.76□□□□□ -1.81
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.76□□□□□ -1.81
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.47□□□□□ -1.85
TSNARE1-204ENST00000519651 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.4□□□□□ -1.86
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.27□□□□□ -1.89
TSNARE1-204ENST00000519651 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.13□□□□□ -1.91
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.08□□□□□ -1.92
TSNARE1-204ENST00000519651 LCE1FQ5T754 118 aa2.96□□□□□ -1.94
TSNARE1-204ENST00000519651 PHGR1C9JFL3 82 aa2.83□□□□□ -1.96
TSNARE1-204ENST00000519651 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.75□□□□□ -1.97
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.58□□□□□ -2
TSNARE1-204ENST00000519651 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.2 ms