RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

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Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 MUC12Q9UKN1 5478 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa9.44□□□□□ -0.9
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HOXB3-210ENST00000489475 LCE3CQ5T5A8 94 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB3-210ENST00000489475 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa9.32□□□□□ -0.92
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HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.23□□□□□ -0.93
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HOXB3-210ENST00000489475 SPRR2AP35326 72 aa9.16□□□□□ -0.94
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HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa8.87□□□□□ -0.99
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HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
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HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.15□□□□□ -1.1
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HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa7.43□□□□□ -1.22
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HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB3-210ENST00000489475 LCE3DQ9BYE3 92 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXB3-210ENST00000489475 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXB3-210ENST00000489475 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.7□□□□□ -1.34
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HOXB3-210ENST00000489475 PRM1P04553 51 aa5.95□□□□□ -1.46
HOXB3-210ENST00000489475 MUC5ACP98088 5654 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HOXB3-210ENST00000489475 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5□□□□□ -1.61
HOXB3-210ENST00000489475 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
HOXB3-210ENST00000489475 LCE1FQ5T754 118 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.69□□□□□ -1.66
HOXB3-210ENST00000489475 PHGR1C9JFL3 82 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXB3-210ENST00000489475 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4□□□□□ -1.77
HOXB3-210ENST00000489475 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.8□□□□□ -1.8
HOXB3-210ENST00000489475 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.88□□□□□ -1.95
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