RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.8□□□□□ -1.8
CTPS1-210ENST00000486889 PMAIP1Q13794 54 aa3.79□□□□□ -1.8
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP5-9P26371 169 aa3.78□□□□□ -1.8
CTPS1-210ENST00000486889 PRO0628Q9UI54 55 aa3.78□□□□□ -1.8
CTPS1-210ENST00000486889 PP632Q6XCG6 107 aa3.76□□□□□ -1.81
CTPS1-210ENST00000486889 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.75□□□□□ -1.81
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.74□□□□□ -1.81
CTPS1-210ENST00000486889 SPRR2EP22531 72 aa3.72□□□□□ -1.81
CTPS1-210ENST00000486889 SPRR2BP35325 72 aa3.72□□□□□ -1.81
CTPS1-210ENST00000486889 SPRR2AP35326 72 aa3.72□□□□□ -1.81
CTPS1-210ENST00000486889 NEBP20929 6669 aa3.72□□□□□ -1.81
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.71□□□□□ -1.82
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.7□□□□□ -1.82
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.7□□□□□ -1.82
CTPS1-210ENST00000486889 KMT2DO14686 5537 aa3.7□□□□□ -1.82
CTPS1-210ENST00000486889 LCE3AQ5TA76 89 aa3.69□□□□□ -1.82
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.69□□□□□ -1.82
CTPS1-210ENST00000486889 MDN1Q9NU22 5596 aa3.69□□□□□ -1.82
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFAF8A1L188 74 aa3.65□□□□□ -1.83
CTPS1-210ENST00000486889 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.64□□□□□ -1.83
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP12-3P60328 96 aa3.62□□□□□ -1.83
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.62□□□□□ -1.83
CTPS1-210ENST00000486889 SPRR2DP22532 72 aa3.6□□□□□ -1.83
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.58□□□□□ -1.84
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.58□□□□□ -1.84
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.58□□□□□ -1.84
CTPS1-210ENST00000486889 MT1EP04732 61 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-210ENST00000486889 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.53□□□□□ -1.84
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.52□□□□□ -1.85
CTPS1-210ENST00000486889 MT1GP13640 62 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-210ENST00000486889 MT1LQ93083 61 aa3.46□□□□□ -1.86
CTPS1-210ENST00000486889 MT3P25713 68 aa3.4□□□□□ -1.87
CTPS1-210ENST00000486889 MT1MQ8N339 61 aa3.37□□□□□ -1.87
CTPS1-210ENST00000486889 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.35□□□□□ -1.87
CTPS1-210ENST00000486889 LCE1FQ5T754 118 aa3.23□□□□□ -1.89
CTPS1-210ENST00000486889 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.21□□□□□ -1.9
CTPS1-210ENST00000486889 MT4P47944 62 aa3.17□□□□□ -1.9
CTPS1-210ENST00000486889 LUZP6Q538Z0 58 aa3.09□□□□□ -1.91
CTPS1-210ENST00000486889 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.07□□□□□ -1.92
CTPS1-210ENST00000486889 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.05□□□□□ -1.92
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP12-4P60329 112 aa3.04□□□□□ -1.92
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.02□□□□□ -1.93
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.01□□□□□ -1.93
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3□□□□□ -1.93
CTPS1-210ENST00000486889 HMCN1Q96RW7 5635 aa3□□□□□ -1.93
CTPS1-210ENST00000486889 MT1AP04731 61 aa2.98□□□□□ -1.93
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.94□□□□□ -1.94
CTPS1-210ENST00000486889 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.89□□□□□ -1.95
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.89□□□□□ -1.95
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.88□□□□□ -1.95
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.84□□□□□ -1.95
CTPS1-210ENST00000486889 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.77□□□□□ -1.97
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.73□□□□□ -1.97
CTPS1-210ENST00000486889 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
CTPS1-210ENST00000486889 LCE1EQ5T753 118 aa2.68□□□□□ -1.98
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.68□□□□□ -1.98
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP5-8O75690 187 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-210ENST00000486889 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.52□□□□□ -2.01
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.5□□□□□ -2.01
CTPS1-210ENST00000486889 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.5□□□□□ -2.01
CTPS1-210ENST00000486889 MUC5ACP98088 5654 aa2.43□□□□□ -2.02
CTPS1-210ENST00000486889 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CTPS1-210ENST00000486889 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.36□□□□□ -2.03
CTPS1-210ENST00000486889 INE1O15225 51 aa2.31□□□□□ -2.04
CTPS1-210ENST00000486889 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.27□□□□□ -2.05
CTPS1-210ENST00000486889 LCE1CQ5T751 118 aa2.26□□□□□ -2.05
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CTPS1-210ENST00000486889 PRM1P04553 51 aa1.95□□□□□ -2.1
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.88□□□□□ -2.11
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.85□□□□□ -2.11
CTPS1-210ENST00000486889 PHGR1C9JFL3 82 aa1.78□□□□□ -2.12
CTPS1-210ENST00000486889 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.55□□□□□ -2.16
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.33□□□□□ -2.2
CTPS1-210ENST00000486889 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.07□□□□□ -2.24
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