RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421367.6

ERLIN1-203, Transcript of ER lipid raft associated 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ERLIN1, Length 5,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN1-203ENST00000421367 MT1EP04732 61 aa5.79□□□□□ -1.48
ERLIN1-203ENST00000421367 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.74□□□□□ -1.49
ERLIN1-203ENST00000421367 MT3P25713 68 aa5.69□□□□□ -1.5
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.66□□□□□ -1.5
ERLIN1-203ENST00000421367 LCE1DQ5T752 114 aa5.64□□□□□ -1.51
ERLIN1-203ENST00000421367 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.63□□□□□ -1.51
ERLIN1-203ENST00000421367 MT4P47944 62 aa5.61□□□□□ -1.51
ERLIN1-203ENST00000421367 MT1MQ8N339 61 aa5.59□□□□□ -1.51
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.58□□□□□ -1.52
ERLIN1-203ENST00000421367 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.56□□□□□ -1.52
ERLIN1-203ENST00000421367 RNF213Q63HN8 5207 aa5.56□□□□□ -1.52
ERLIN1-203ENST00000421367 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ERLIN1-203ENST00000421367 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.48□□□□□ -1.53
ERLIN1-203ENST00000421367 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.43□□□□□ -1.54
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.42□□□□□ -1.54
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.37□□□□□ -1.55
ERLIN1-203ENST00000421367 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.31□□□□□ -1.56
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.28□□□□□ -1.56
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.27□□□□□ -1.57
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.22□□□□□ -1.57
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ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.18□□□□□ -1.58
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.18□□□□□ -1.58
ERLIN1-203ENST00000421367 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.18□□□□□ -1.58
ERLIN1-203ENST00000421367 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.18□□□□□ -1.58
ERLIN1-203ENST00000421367 MT1AP04731 61 aa5.16□□□□□ -1.58
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.13□□□□□ -1.59
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ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.99□□□□□ -1.61
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ERLIN1-203ENST00000421367 LCE1EQ5T753 118 aa4.98□□□□□ -1.61
ERLIN1-203ENST00000421367 LCE1FQ5T754 118 aa4.98□□□□□ -1.61
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ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.9□□□□□ -1.63
ERLIN1-203ENST00000421367 LCE4AQ5TA78 99 aa4.89□□□□□ -1.63
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.81□□□□□ -1.64
ERLIN1-203ENST00000421367 USH2AO75445 5202 aa4.64□□□□□ -1.67
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP5-9P26371 169 aa4.54□□□□□ -1.68
ERLIN1-203ENST00000421367 KMT2DO14686 5537 aa4.51□□□□□ -1.69
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.45□□□□□ -1.7
ERLIN1-203ENST00000421367 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ERLIN1-203ENST00000421367 SSPOA2VEC9 5147 aa4.4□□□□□ -1.71
ERLIN1-203ENST00000421367 NEBP20929 6669 aa4.34□□□□□ -1.71
ERLIN1-203ENST00000421367 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ERLIN1-203ENST00000421367 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.32□□□□□ -1.72
ERLIN1-203ENST00000421367 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.16□□□□□ -1.74
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.14□□□□□ -1.75
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.09□□□□□ -1.75
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4□□□□□ -1.77
ERLIN1-203ENST00000421367 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.94□□□□□ -1.78
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.91□□□□□ -1.78
ERLIN1-203ENST00000421367 MDN1Q9NU22 5596 aa3.89□□□□□ -1.79
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.79□□□□□ -1.8
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.79□□□□□ -1.8
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ERLIN1-203ENST00000421367 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.69□□□□□ -1.82
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.46□□□□□ -1.85
ERLIN1-203ENST00000421367 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.22□□□□□ -1.89
ERLIN1-203ENST00000421367 MUC5ACP98088 5654 aa3.16□□□□□ -1.9
ERLIN1-203ENST00000421367 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.14□□□□□ -1.91
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP5-8O75690 187 aa3.13□□□□□ -1.91
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.12□□□□□ -1.91
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.93□□□□□ -1.94
ERLIN1-203ENST00000421367 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.72□□□□□ -1.97
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.72□□□□□ -1.97
ERLIN1-203ENST00000421367 PHGR1C9JFL3 82 aa2.7□□□□□ -1.98
ERLIN1-203ENST00000421367 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.56□□□□□ -2
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.55□□□□□ -2
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
ERLIN1-203ENST00000421367 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.38□□□□□ -2.03
ERLIN1-203ENST00000421367 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 178 ms