RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 MT1MQ8N339 61 aa5.15□□□□□ -1.58
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.12□□□□□ -1.59
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC2Q02817 5179 aa5.11□□□□□ -1.59
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.08□□□□□ -1.6
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.08□□□□□ -1.6
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.08□□□□□ -1.6
CTDSP2-201ENST00000398073 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CTDSP2-201ENST00000398073 SPRR2DP22532 72 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSP2-201ENST00000398073 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-201ENST00000398073 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.03□□□□□ -1.6
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.95□□□□□ -1.62
CTDSP2-201ENST00000398073 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.91□□□□□ -1.62
CTDSP2-201ENST00000398073 PRM1P04553 51 aa4.83□□□□□ -1.64
CTDSP2-201ENST00000398073 MT3P25713 68 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-201ENST00000398073 MT1AP04731 61 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-201ENST00000398073 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.7□□□□□ -1.66
CTDSP2-201ENST00000398073 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.6□□□□□ -1.67
CTDSP2-201ENST00000398073 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.59□□□□□ -1.67
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.56□□□□□ -1.68
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-201ENST00000398073 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CTDSP2-201ENST00000398073 USH2AO75445 5202 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-201ENST00000398073 MT4P47944 62 aa4.47□□□□□ -1.69
CTDSP2-201ENST00000398073 KMT2DO14686 5537 aa4.46□□□□□ -1.69
CTDSP2-201ENST00000398073 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.46□□□□□ -1.7
CTDSP2-201ENST00000398073 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CTDSP2-201ENST00000398073 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.39□□□□□ -1.71
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.38□□□□□ -1.71
CTDSP2-201ENST00000398073 LCE1DQ5T752 114 aa4.35□□□□□ -1.71
CTDSP2-201ENST00000398073 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.32□□□□□ -1.72
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.31□□□□□ -1.72
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.2□□□□□ -1.74
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.16□□□□□ -1.74
CTDSP2-201ENST00000398073 SSPOA2VEC9 5147 aa4.11□□□□□ -1.75
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.09□□□□□ -1.75
CTDSP2-201ENST00000398073 LCE4AQ5TA78 99 aa4.05□□□□□ -1.76
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CTDSP2-201ENST00000398073 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.96□□□□□ -1.78
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP5-9P26371 169 aa3.96□□□□□ -1.78
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.86□□□□□ -1.79
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
CTDSP2-201ENST00000398073 MDN1Q9NU22 5596 aa3.66□□□□□ -1.82
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.64□□□□□ -1.83
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.6□□□□□ -1.83
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.56□□□□□ -1.84
CTDSP2-201ENST00000398073 LCE1EQ5T753 118 aa3.55□□□□□ -1.84
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.55□□□□□ -1.84
CTDSP2-201ENST00000398073 NEBP20929 6669 aa3.53□□□□□ -1.84
CTDSP2-201ENST00000398073 LCE1CQ5T751 118 aa3.43□□□□□ -1.86
CTDSP2-201ENST00000398073 LCE1FQ5T754 118 aa3.43□□□□□ -1.86
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.33□□□□□ -1.88
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.24□□□□□ -1.89
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC5ACP98088 5654 aa3.13□□□□□ -1.91
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.12□□□□□ -1.91
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2-201ENST00000398073 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.95□□□□□ -1.94
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.94□□□□□ -1.94
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.91□□□□□ -1.94
CTDSP2-201ENST00000398073 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.76□□□□□ -1.97
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP5-8O75690 187 aa2.61□□□□□ -1.99
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.53□□□□□ -2.01
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.52□□□□□ -2.01
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.52□□□□□ -2.01
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.37□□□□□ -2.03
CTDSP2-201ENST00000398073 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.1□□□□□ -2.07
CTDSP2-201ENST00000398073 PHGR1C9JFL3 82 aa2.1□□□□□ -2.07
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.36□□□□□ -2.19
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms