RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 CRIPTQ9P021 101 aa2.74□□□□□ -1.97
C6orf48-208ENST00000395788 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.73□□□□□ -1.97
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C6orf48-208ENST00000395788 R4GN34 69 aa2.72□□□□□ -1.97
C6orf48-208ENST00000395788 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0D9SG42 100 aa2.71□□□□□ -1.98
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C6orf48-208ENST00000395788 M0R2T5 61 aa2.69□□□□□ -1.98
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C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.35□□□□□ -2.03
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C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.22□□□□□ -2.05
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C6orf48-208ENST00000395788 MDN1Q9NU22 5596 aa2.15□□□□□ -2.06
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C6orf48-208ENST00000395788 MT4P47944 62 aa1.71□□□□□ -2.14
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP12-4P60329 112 aa1.69□□□□□ -2.14
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C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.62□□□□□ -2.15
C6orf48-208ENST00000395788 PRM1P04553 51 aa1.36□□□□□ -2.19
C6orf48-208ENST00000395788 PHGR1C9JFL3 82 aa1.29□□□□□ -2.2
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.96□□□□□ -2.26
C6orf48-208ENST00000395788 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.81□□□□□ -2.28
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