RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.27□□□□□ -1.41
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LTV1-201ENST00000367576 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.27□□□□□ -1.41
LTV1-201ENST00000367576 SPRR2EP22531 72 aa6.25□□□□□ -1.41
LTV1-201ENST00000367576 SPRR2BP35325 72 aa6.25□□□□□ -1.41
LTV1-201ENST00000367576 SPRR2AP35326 72 aa6.25□□□□□ -1.41
LTV1-201ENST00000367576 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.24□□□□□ -1.41
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LTV1-201ENST00000367576 MT1GP13640 62 aa6.17□□□□□ -1.42
LTV1-201ENST00000367576 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.16□□□□□ -1.42
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LTV1-201ENST00000367576 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.04□□□□□ -1.44
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LTV1-201ENST00000367576 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.84□□□□□ -1.63
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.83□□□□□ -1.64
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.81□□□□□ -1.64
LTV1-201ENST00000367576 A0A0A0MQY5 61 aa4.67□□□□□ -1.66
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LTV1-201ENST00000367576 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.57□□□□□ -1.68
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LTV1-201ENST00000367576 H3BS24 57 aa4.44□□□□□ -1.7
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LTV1-201ENST00000367576 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.36□□□□□ -1.71
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LTV1-201ENST00000367576 KRTAP5-8O75690 187 aa4.23□□□□□ -1.73
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LTV1-201ENST00000367576 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.2□□□□□ -1.74
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LTV1-201ENST00000367576 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.04□□□□□ -1.76
LTV1-201ENST00000367576 MUC5ACP98088 5654 aa4□□□□□ -1.77
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LTV1-201ENST00000367576 PRM1P04553 51 aa3.83□□□□□ -1.8
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LTV1-201ENST00000367576 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.51□□□□□ -1.85
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.49□□□□□ -1.85
LTV1-201ENST00000367576 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.2□□□□□ -1.9
LTV1-201ENST00000367576 LCE1FQ5T754 118 aa3.16□□□□□ -1.9
LTV1-201ENST00000367576 PHGR1C9JFL3 82 aa3.02□□□□□ -1.93
LTV1-201ENST00000367576 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.69□□□□□ -1.98
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.26□□□□□ -2.05
LTV1-201ENST00000367576 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.97□□□□□ -2.09
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