RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf95Q9H7T3 257 aa1.79□□□□□ -2.12
PTPRC-201ENST00000348564 LCE1DQ5T752 114 aa1.79□□□□□ -2.12
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa1.78□□□□□ -2.12
PTPRC-201ENST00000348564 MT1BP07438 61 aa1.77□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 KMT2DO14686 5537 aa1.77□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.77□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa1.76□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP12-3P60328 96 aa1.75□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP5-9P26371 169 aa1.74□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa1.73□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.72□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 LCE3AQ5TA76 89 aa1.72□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 USH2AO75445 5202 aa1.72□□□□□ -2.13
PTPRC-201ENST00000348564 MT1XP80297 61 aa1.71□□□□□ -2.14
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP23-1A1A580 65 aa1.69□□□□□ -2.14
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRC-201ENST00000348564 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRC-201ENST00000348564 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRC-201ENST00000348564 SSPOA2VEC9 5147 aa1.65□□□□□ -2.14
PTPRC-201ENST00000348564 LCE4AQ5TA78 99 aa1.65□□□□□ -2.14
PTPRC-201ENST00000348564 MT4P47944 62 aa1.64□□□□□ -2.15
PTPRC-201ENST00000348564 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.63□□□□□ -2.15
PTPRC-201ENST00000348564 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP12-4P60329 112 aa1.62□□□□□ -2.15
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa1.62□□□□□ -2.15
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.62□□□□□ -2.15
PTPRC-201ENST00000348564 INE1O15225 51 aa1.62□□□□□ -2.15
PTPRC-201ENST00000348564 MT1GP13640 62 aa1.62□□□□□ -2.15
PTPRC-201ENST00000348564 NEBP20929 6669 aa1.61□□□□□ -2.15
PTPRC-201ENST00000348564 LCE5AQ5TCM9 118 aa1.59□□□□□ -2.15
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.59□□□□□ -2.16
PTPRC-201ENST00000348564 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.59□□□□□ -2.16
PTPRC-201ENST00000348564 MDN1Q9NU22 5596 aa1.58□□□□□ -2.16
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.57□□□□□ -2.16
PTPRC-201ENST00000348564 LCE1AQ5T7P2 110 aa1.54□□□□□ -2.16
PTPRC-201ENST00000348564 MT1EP04732 61 aa1.53□□□□□ -2.16
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa1.52□□□□□ -2.17
PTPRC-201ENST00000348564 LCE3CQ5T5A8 94 aa1.49□□□□□ -2.17
PTPRC-201ENST00000348564 MT1MQ8N339 61 aa1.49□□□□□ -2.17
PTPRC-201ENST00000348564 MT1LQ93083 61 aa1.49□□□□□ -2.17
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa1.48□□□□□ -2.17
PTPRC-201ENST00000348564 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.47□□□□□ -2.17
PTPRC-201ENST00000348564 MT3P25713 68 aa1.44□□□□□ -2.18
PTPRC-201ENST00000348564 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.38□□□□□ -2.19
PTPRC-201ENST00000348564 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.37□□□□□ -2.19
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa1.35□□□□□ -2.19
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP5-8O75690 187 aa1.34□□□□□ -2.19
PTPRC-201ENST00000348564 MT1AP04731 61 aa1.31□□□□□ -2.2
PTPRC-201ENST00000348564 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.28□□□□□ -2.2
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.28□□□□□ -2.2
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
PTPRC-201ENST00000348564 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.27□□□□□ -2.21
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.27□□□□□ -2.21
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.22□□□□□ -2.21
PTPRC-201ENST00000348564 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.21□□□□□ -2.22
PTPRC-201ENST00000348564 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.21□□□□□ -2.22
PTPRC-201ENST00000348564 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.2□□□□□ -2.22
PTPRC-201ENST00000348564 LCE1CQ5T751 118 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRC-201ENST00000348564 LCE1EQ5T753 118 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRC-201ENST00000348564 LCE1FQ5T754 118 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRC-201ENST00000348564 MUC5ACP98088 5654 aa1.15□□□□□ -2.23
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.08□□□□□ -2.24
PTPRC-201ENST00000348564 PRM1P04553 51 aa1.02□□□□□ -2.25
PTPRC-201ENST00000348564 PHGR1C9JFL3 82 aa0.92□□□□□ -2.26
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa0.79□□□□□ -2.28
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.71□□□□□ -2.3
PTPRC-201ENST00000348564 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.57□□□□□ -2.32
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