RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340305.9

TMEM201-201, Transcript of transmembrane protein 201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM201, Length 3,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201-201ENST00000340305 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
TMEM201-201ENST00000340305 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.61□□□□□ -1.67
TMEM201-201ENST00000340305 MT1GP13640 62 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM201-201ENST00000340305 MT1EP04732 61 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM201-201ENST00000340305 SSPOA2VEC9 5147 aa4.52□□□□□ -1.69
TMEM201-201ENST00000340305 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.51□□□□□ -1.69
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP12-4P60329 112 aa4.51□□□□□ -1.69
TMEM201-201ENST00000340305 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.39□□□□□ -1.71
TMEM201-201ENST00000340305 LCE3BQ5TA77 95 aa4.39□□□□□ -1.71
TMEM201-201ENST00000340305 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
TMEM201-201ENST00000340305 MT1MQ8N339 61 aa4.3□□□□□ -1.72
TMEM201-201ENST00000340305 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.23□□□□□ -1.73
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.21□□□□□ -1.74
TMEM201-201ENST00000340305 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.21□□□□□ -1.74
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.12□□□□□ -1.75
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.09□□□□□ -1.75
TMEM201-201ENST00000340305 PRM1P04553 51 aa4.04□□□□□ -1.76
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.04□□□□□ -1.76
TMEM201-201ENST00000340305 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.04□□□□□ -1.76
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.04□□□□□ -1.76
TMEM201-201ENST00000340305 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
TMEM201-201ENST00000340305 MDN1Q9NU22 5596 aa3.99□□□□□ -1.77
TMEM201-201ENST00000340305 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.97□□□□□ -1.77
TMEM201-201ENST00000340305 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.97□□□□□ -1.77
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
TMEM201-201ENST00000340305 MT1AP04731 61 aa3.82□□□□□ -1.8
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.78□□□□□ -1.8
TMEM201-201ENST00000340305 SPRR2EP22531 72 aa3.69□□□□□ -1.82
TMEM201-201ENST00000340305 SPRR2BP35325 72 aa3.69□□□□□ -1.82
TMEM201-201ENST00000340305 SPRR2AP35326 72 aa3.69□□□□□ -1.82
TMEM201-201ENST00000340305 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.65□□□□□ -1.83
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.58□□□□□ -1.84
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.56□□□□□ -1.84
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.51□□□□□ -1.85
TMEM201-201ENST00000340305 SPRR2DP22532 72 aa3.49□□□□□ -1.85
TMEM201-201ENST00000340305 MT3P25713 68 aa3.48□□□□□ -1.85
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.46□□□□□ -1.86
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP5-9P26371 169 aa3.33□□□□□ -1.88
TMEM201-201ENST00000340305 MT4P47944 62 aa3.28□□□□□ -1.88
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
TMEM201-201ENST00000340305 LCE1EQ5T753 118 aa3.22□□□□□ -1.89
TMEM201-201ENST00000340305 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.21□□□□□ -1.9
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.2□□□□□ -1.9
TMEM201-201ENST00000340305 LCE1DQ5T752 114 aa3.16□□□□□ -1.9
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.12□□□□□ -1.91
TMEM201-201ENST00000340305 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.1□□□□□ -1.91
TMEM201-201ENST00000340305 MUC5ACP98088 5654 aa3.09□□□□□ -1.91
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.96□□□□□ -1.94
TMEM201-201ENST00000340305 NEBP20929 6669 aa2.96□□□□□ -1.94
TMEM201-201ENST00000340305 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.95□□□□□ -1.94
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.94□□□□□ -1.94
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.93□□□□□ -1.94
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.79□□□□□ -1.96
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.76□□□□□ -1.97
TMEM201-201ENST00000340305 LCE4AQ5TA78 99 aa2.72□□□□□ -1.97
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.68□□□□□ -1.98
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.65□□□□□ -1.98
TMEM201-201ENST00000340305 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.59□□□□□ -1.99
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.57□□□□□ -2
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.56□□□□□ -2
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.47□□□□□ -2.01
TMEM201-201ENST00000340305 LCE1CQ5T751 118 aa2.45□□□□□ -2.02
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.41□□□□□ -2.02
TMEM201-201ENST00000340305 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
TMEM201-201ENST00000340305 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.34□□□□□ -2.04
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.32□□□□□ -2.04
TMEM201-201ENST00000340305 LCE1FQ5T754 118 aa2.32□□□□□ -2.04
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.2□□□□□ -2.06
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP5-8O75690 187 aa2.19□□□□□ -2.06
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.05□□□□□ -2.08
TMEM201-201ENST00000340305 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.01□□□□□ -2.09
TMEM201-201ENST00000340305 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
TMEM201-201ENST00000340305 PHGR1C9JFL3 82 aa1.82□□□□□ -2.12
TMEM201-201ENST00000340305 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.31□□□□□ -2.2
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