RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-201ENST00000332175 MUC17Q685J3 4493 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-201ENST00000332175 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-201ENST00000332175 LCE1DQ5T752 114 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-201ENST00000332175 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-201ENST00000332175 MT1AP04731 61 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-201ENST00000332175 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-201ENST00000332175 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-201ENST00000332175 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-201ENST00000332175 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-201ENST00000332175 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-201ENST00000332175 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRM-201ENST00000332175 RNF213Q63HN8 5207 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-201ENST00000332175 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-201ENST00000332175 MUC2Q02817 5179 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-201ENST00000332175 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-201ENST00000332175 LCE1CQ5T751 118 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-201ENST00000332175 LCE1EQ5T753 118 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-201ENST00000332175 LCE1FQ5T754 118 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-201ENST00000332175 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-201ENST00000332175 LCE4AQ5TA78 99 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-201ENST00000332175 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-201ENST00000332175 USH2AO75445 5202 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-201ENST00000332175 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-201ENST00000332175 KMT2DO14686 5537 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-201ENST00000332175 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRM-201ENST00000332175 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
PTPRM-201ENST00000332175 NEBP20929 6669 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP5-9P26371 169 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRM-201ENST00000332175 SSPOA2VEC9 5147 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-201ENST00000332175 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRM-201ENST00000332175 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-201ENST00000332175 MDN1Q9NU22 5596 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-201ENST00000332175 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-201ENST00000332175 MUC5ACP98088 5654 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP5-8O75690 187 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-201ENST00000332175 PHGR1C9JFL3 82 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-201ENST00000332175 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-201ENST00000332175 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-201ENST00000332175 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-201ENST00000332175 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRM-201ENST00000332175 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.99□□□□□ -2.09
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