RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.05□□□□□ -1.28
SYTL1-201ENST00000318074 LUZP6Q538Z0 58 aa7.03□□□□□ -1.28
SYTL1-201ENST00000318074 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.01□□□□□ -1.29
SYTL1-201ENST00000318074 MDN1Q9NU22 5596 aa6.94□□□□□ -1.3
SYTL1-201ENST00000318074 MT1LQ93083 61 aa6.88□□□□□ -1.31
SYTL1-201ENST00000318074 SPRR2EP22531 72 aa6.86□□□□□ -1.31
SYTL1-201ENST00000318074 SPRR2BP35325 72 aa6.86□□□□□ -1.31
SYTL1-201ENST00000318074 SPRR2AP35326 72 aa6.86□□□□□ -1.31
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.86□□□□□ -1.31
SYTL1-201ENST00000318074 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.86□□□□□ -1.31
SYTL1-201ENST00000318074 MT1GP13640 62 aa6.79□□□□□ -1.32
SYTL1-201ENST00000318074 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.77□□□□□ -1.33
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.74□□□□□ -1.33
SYTL1-201ENST00000318074 NEBP20929 6669 aa6.74□□□□□ -1.33
SYTL1-201ENST00000318074 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.67□□□□□ -1.34
SYTL1-201ENST00000318074 MT1MQ8N339 61 aa6.67□□□□□ -1.34
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.63□□□□□ -1.35
SYTL1-201ENST00000318074 SPRR2DP22532 72 aa6.62□□□□□ -1.35
SYTL1-201ENST00000318074 A0A0A0MQY5 61 aa6.61□□□□□ -1.35
SYTL1-201ENST00000318074 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.52□□□□□ -1.37
SYTL1-201ENST00000318074 LCE3BQ5TA77 95 aa6.37□□□□□ -1.39
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.31□□□□□ -1.4
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.31□□□□□ -1.4
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.27□□□□□ -1.41
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.26□□□□□ -1.41
SYTL1-201ENST00000318074 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.24□□□□□ -1.41
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.17□□□□□ -1.42
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.17□□□□□ -1.42
SYTL1-201ENST00000318074 INE1O15225 51 aa6.07□□□□□ -1.44
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.89□□□□□ -1.47
SYTL1-201ENST00000318074 LCE4AQ5TA78 99 aa5.86□□□□□ -1.47
SYTL1-201ENST00000318074 MT1AP04731 61 aa5.86□□□□□ -1.47
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.8□□□□□ -1.48
SYTL1-201ENST00000318074 MT4P47944 62 aa5.76□□□□□ -1.49
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.75□□□□□ -1.49
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP12-4P60329 112 aa5.73□□□□□ -1.49
SYTL1-201ENST00000318074 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SYTL1-201ENST00000318074 LCE1DQ5T752 114 aa5.68□□□□□ -1.5
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.66□□□□□ -1.5
SYTL1-201ENST00000318074 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.62□□□□□ -1.51
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.6□□□□□ -1.51
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.53□□□□□ -1.52
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.4□□□□□ -1.54
SYTL1-201ENST00000318074 MT3P25713 68 aa5.35□□□□□ -1.55
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.32□□□□□ -1.56
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.29□□□□□ -1.56
SYTL1-201ENST00000318074 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.08□□□□□ -1.6
SYTL1-201ENST00000318074 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.04□□□□□ -1.6
SYTL1-201ENST00000318074 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.98□□□□□ -1.61
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.87□□□□□ -1.63
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.85□□□□□ -1.63
SYTL1-201ENST00000318074 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.83□□□□□ -1.64
SYTL1-201ENST00000318074 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.8□□□□□ -1.64
SYTL1-201ENST00000318074 LCE1EQ5T753 118 aa4.7□□□□□ -1.66
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP5-8O75690 187 aa4.68□□□□□ -1.66
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SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.54□□□□□ -1.68
SYTL1-201ENST00000318074 PRM1P04553 51 aa4.47□□□□□ -1.69
SYTL1-201ENST00000318074 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.42□□□□□ -1.7
SYTL1-201ENST00000318074 MUC5ACP98088 5654 aa4.42□□□□□ -1.7
SYTL1-201ENST00000318074 LCE1CQ5T751 118 aa4.38□□□□□ -1.71
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.36□□□□□ -1.71
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.31□□□□□ -1.72
SYTL1-201ENST00000318074 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
SYTL1-201ENST00000318074 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.87□□□□□ -1.79
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.8□□□□□ -1.8
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.72□□□□□ -1.81
SYTL1-201ENST00000318074 LCE1FQ5T754 118 aa3.58□□□□□ -1.84
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.4□□□□□ -1.86
SYTL1-201ENST00000318074 PHGR1C9JFL3 82 aa3.34□□□□□ -1.88
SYTL1-201ENST00000318074 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.02□□□□□ -1.93
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.85□□□□□ -1.95
SYTL1-201ENST00000318074 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.06□□□□□ -2.08
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