RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.87□□□□□ -1.47
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CHTF18-202ENST00000317063 MDN1Q9NU22 5596 aa5.78□□□□□ -1.48
CHTF18-202ENST00000317063 MT1LQ93083 61 aa5.76□□□□□ -1.49
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.75□□□□□ -1.49
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP5-9P26371 169 aa5.68□□□□□ -1.5
CHTF18-202ENST00000317063 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.66□□□□□ -1.5
CHTF18-202ENST00000317063 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.64□□□□□ -1.51
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.6□□□□□ -1.51
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.6□□□□□ -1.51
CHTF18-202ENST00000317063 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.57□□□□□ -1.52
CHTF18-202ENST00000317063 MT1GP13640 62 aa5.56□□□□□ -1.52
CHTF18-202ENST00000317063 SPRR2EP22531 72 aa5.55□□□□□ -1.52
CHTF18-202ENST00000317063 SPRR2BP35325 72 aa5.55□□□□□ -1.52
CHTF18-202ENST00000317063 SPRR2AP35326 72 aa5.55□□□□□ -1.52
CHTF18-202ENST00000317063 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.55□□□□□ -1.52
CHTF18-202ENST00000317063 MT1MQ8N339 61 aa5.55□□□□□ -1.52
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.53□□□□□ -1.52
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.45□□□□□ -1.54
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.45□□□□□ -1.54
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.41□□□□□ -1.54
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.41□□□□□ -1.54
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.41□□□□□ -1.54
CHTF18-202ENST00000317063 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.4□□□□□ -1.55
CHTF18-202ENST00000317063 SPRR2DP22532 72 aa5.33□□□□□ -1.56
CHTF18-202ENST00000317063 NEBP20929 6669 aa5.3□□□□□ -1.56
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP12-4P60329 112 aa5.13□□□□□ -1.59
CHTF18-202ENST00000317063 LCE3BQ5TA77 95 aa5.12□□□□□ -1.59
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.07□□□□□ -1.6
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
CHTF18-202ENST00000317063 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.91□□□□□ -1.62
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.86□□□□□ -1.63
CHTF18-202ENST00000317063 MT1AP04731 61 aa4.84□□□□□ -1.63
CHTF18-202ENST00000317063 LCE1EQ5T753 118 aa4.78□□□□□ -1.64
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.73□□□□□ -1.65
CHTF18-202ENST00000317063 MT4P47944 62 aa4.73□□□□□ -1.65
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.73□□□□□ -1.65
CHTF18-202ENST00000317063 PRM1P04553 51 aa4.68□□□□□ -1.66
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.68□□□□□ -1.66
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.63□□□□□ -1.67
CHTF18-202ENST00000317063 LCE4AQ5TA78 99 aa4.61□□□□□ -1.67
CHTF18-202ENST00000317063 LCE1DQ5T752 114 aa4.59□□□□□ -1.67
CHTF18-202ENST00000317063 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.59□□□□□ -1.67
CHTF18-202ENST00000317063 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.57□□□□□ -1.68
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.54□□□□□ -1.68
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.48□□□□□ -1.69
CHTF18-202ENST00000317063 MT3P25713 68 aa4.39□□□□□ -1.71
CHTF18-202ENST00000317063 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.31□□□□□ -1.72
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.3□□□□□ -1.72
CHTF18-202ENST00000317063 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.29□□□□□ -1.72
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.27□□□□□ -1.73
CHTF18-202ENST00000317063 LCE1FQ5T754 118 aa4.25□□□□□ -1.73
CHTF18-202ENST00000317063 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.01□□□□□ -1.77
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.91□□□□□ -1.78
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.81□□□□□ -1.8
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.77□□□□□ -1.81
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.76□□□□□ -1.81
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP5-8O75690 187 aa3.75□□□□□ -1.81
CHTF18-202ENST00000317063 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.72□□□□□ -1.81
CHTF18-202ENST00000317063 MUC5ACP98088 5654 aa3.67□□□□□ -1.82
CHTF18-202ENST00000317063 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.65□□□□□ -1.83
CHTF18-202ENST00000317063 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.61□□□□□ -1.83
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.6□□□□□ -1.83
CHTF18-202ENST00000317063 LCE1CQ5T751 118 aa3.54□□□□□ -1.84
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.51□□□□□ -1.85
CHTF18-202ENST00000317063 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.18□□□□□ -1.9
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.16□□□□□ -1.9
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.1□□□□□ -1.91
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.99□□□□□ -1.93
CHTF18-202ENST00000317063 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.98□□□□□ -1.93
CHTF18-202ENST00000317063 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
CHTF18-202ENST00000317063 PHGR1C9JFL3 82 aa2.7□□□□□ -1.98
CHTF18-202ENST00000317063 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.69□□□□□ -2.14
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