RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 Q8IZM0 81 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SVBPQ8N300 66 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 PPDPFLQ8WWR9 84 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 MT1LQ93083 61 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 TMEM141Q96I45 108 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 C7orf77A4D0Y5 90 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 I3L3M4 83 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 M0R143 59 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 INE1O15225 51 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 MPC2O95563 127 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SPINK8P0C7L1 97 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SPRR1BP22528 89 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SPATA45Q537H7 98 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 DEFB107AQ8IZN7 70 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 DMAC1Q96GE9 116 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 KCNQ1DNQ9H478 68 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 PSENENQ9NZ42 101 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 TOMM7Q9P0U1 55 aa0.5□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa0.49□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa0.49□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa0.49□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa0.49□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 A0A1W2PPM0 123 aa0.49□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 HCG22E2RYF7 251 aa0.49□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 NCR3O14931 201 aa0.49□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 S100A8P05109 93 aa0.49□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 C20orf197Q8N268 126 aa0.49□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 LINC00208Q96KT6 92 aa0.49□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 HIGD1CA8MV81 97 aa0.48□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 MT-ATP8P03928 68 aa0.48□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SFTA2Q6UW10 78 aa0.48□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 Q6ZRX8 168 aa0.48□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 FAM213BQ8TBF2 198 aa0.48□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SNHG12Q9BXW3 62 aa0.48□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.48□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 hADV29S1A0JD25 119 aa0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SSSCA1O60232 199 aa0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 Q6ZQY7 126 aa0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 AMELXQ99217 191 aa0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SPANXDQ9BXN6 97 aa0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 MANBALQ9NQG1 85 aa0.47□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 SIX6O95475 246 aa0.46□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R17O96001 155 aa0.46□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 COX7B2Q8TF08 81 aa0.46□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 PMCHL2Q9BQD1 86 aa0.46□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 VAMP8Q9BV40 100 aa0.46□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 Q9H521 79 aa0.46□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 ST20Q9HBF5 79 aa0.46□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 V9GYV3 84 aa0.46□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa0.45□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 D6R8Y8 96 aa0.45□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa0.45□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 FCER1GP30273 86 aa0.45□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 FAUP35544 74 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 SEC11AP67812 179 aa0.45□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.45□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 V9GYH0 126 aa0.45□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa0.44□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 NAP1L6A6NFF2 107 aa0.44□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 F2Z2F3 143 aa0.44□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 F8WEM9 126 aa0.44□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 APOC3P02656 99 aa0.44□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 ACYP2P14621 99 aa0.44□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa0.44□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa0.44□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 TRAV22A0A0B4J277 110 aa0.43□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 MT1AP04731 61 aa0.43□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 RPL39P62891 51 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 COX17Q14061 63 aa0.43□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 LINC00575Q6W349 94 aa0.43□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 C9orf62Q8N4C0 152 aa0.43□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa0.43□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 UQCR10Q9UDW1 63 aa0.43□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa0.43□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 S4R3F8 94 aa0.43□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa0.42□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 ZNF815PA8K554 130 aa0.42□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 SFT2D2O95562 160 aa0.42□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 C3orf79P0CE67 100 aa0.42□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 KRTDAPP60985 99 aa0.42□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 TMEM170BQ5T4T1 132 aa0.42□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 BAGE3Q86Y29 109 aa0.42□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 C20orf78Q9BR46 151 aa0.42□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 PRO1854Q9UHT4 67 aa0.42□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 K7EQZ3 153 aa0.41□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 ATOX1O00244 68 aa0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms