RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-1128P-201ENST00000362825 V9GYY9 64 aa-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC89Q8N998 374 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDRG1Q9NUG6 133 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GSTA5Q7RTV2 222 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSC22D3Q99576 134 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-6.36□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-6.36□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MT-ND4LP03901 98 aa-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNG11P61952 73 aa-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC152Q4G0S7 254 aa-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PFDN5Q99471 154 aa-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CFL2Q9Y281 166 aa-6.38□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CORTO00230 105 aa-6.39□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP-6.39□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYL6P60660 151 aa-6.39□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP-6.39□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERF2P84101 59 aa-6.39□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC42Q96M95 316 aa-6.39□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GID8Q9NWU2 228 aa-6.39□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-6.39□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GW15 77 aa-6.4□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CATR1Q13166 79 aa-6.4□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa-6.4□□□□□ -3.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CXCL11O14625 94 aa-6.41□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLNP26678 52 aa-6.41□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP6V1E2Q96A05 226 aa-6.41□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa-6.42□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-6.42□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAEPP09466 180 aa-6.42□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C6orf50Q9HD87 102 aa-6.42□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SSNA1O43805 119 aa-6.43□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COPS9Q8WXC6 57 aa-6.44□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TBCAO75347 108 aaKnown RBP-6.45□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MED31Q9Y3C7 131 aa-6.45□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PFDN6O15212 129 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BCAP31P51572 246 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNG5P63218 68 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAL1Q4LDG9 190 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNG3P63215 75 aa-6.47□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ETFRF1Q6IPR1 90 aa-6.47□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-6.47□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-6.48□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GABARAPH6UMI1 98 aa-6.48□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CALML5Q9NZT1 146 aa-6.48□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NBEAP1P0C6P0 100 aa-6.49□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C12orf73Q69YU5 71 aa-6.49□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEP19Q96LK0 163 aa-6.49□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa-6.49□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYLPFQ96A32 169 aa-6.5□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 S100A6P06703 90 aa-6.51□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 S100A1P23297 94 aa-6.51□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-6.52□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CABP5Q9NP86 173 aa-6.52□□□□□ -3.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC113Q9H0I3 377 aa-6.54□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 M0R129 80 aa-6.55□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP-6.56□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-6.56□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-6.56□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COMMD10Q9Y6G5 202 aa-6.56□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GV50 99 aa-6.57□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTXN2P0C2S0 81 aa-6.57□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATXN8Q156A1 80 aa-6.57□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GGTA1PQ4G0N0 100 aa-6.57□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNM1P34Q6PK57 102 aa-6.57□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM20Q8N5G0 67 aa-6.57□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PFDN1O60925 122 aa-6.58□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDUFAF4Q9P032 175 aa-6.58□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM24O75264 130 aa-6.59□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP6V1FQ16864 119 aa-6.59□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PFDN4Q9NQP4 134 aa-6.59□□□□□ -3.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BANF1O75531 89 aa-6.6□□□□□ -3.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 S100A9P06702 114 aaKnown RBP-6.6□□□□□ -3.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM12Q96EX1 92 aa-6.6□□□□□ -3.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-6.61□□□□□ -3.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HMGN1P05114 100 aa-6.62□□□□□ -3.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa-6.64□□□□□ -3.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BANF2Q9H503 90 aa-6.65□□□□□ -3.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-6.65□□□□□ -3.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC01549A6NIU2 74 aa-6.66□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM244Q5VVB8 128 aa-6.66□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HYPKQ9NX55 129 aa-6.66□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa-6.66□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP-6.67□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CROCCP2Q86T23 111 aa-6.67□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRPC5OSA6NMA1 111 aa-6.68□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-6.68□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM11AP58511 58 aa-6.68□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-6.68□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LIN52Q52LA3 116 aa-6.7□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC172P0C7W6 258 aa-6.71□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa-6.71□□□□□ -3.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RIIAD1A6NNX1 92 aa-6.72□□□□□ -3.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 S100A11P31949 105 aa-6.72□□□□□ -3.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SIKE1Q9BRV8 207 aa-6.74□□□□□ -3.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa-6.76□□□□□ -3.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86 ms