RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-215ENST00000582821 J3KT08 172 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-215ENST00000582821 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-215ENST00000582821 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-215ENST00000582821 A0A1B0GVX0 72 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-215ENST00000582821 A0A1W2PPM0 123 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-215ENST00000582821 C8orf87E5RJ46 101 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-215ENST00000582821 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-215ENST00000582821 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-215ENST00000582821 H3BT86 120 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-215ENST00000582821 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-215ENST00000582821 NDUFB1O75438 58 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-215ENST00000582821 A8MWP4 228 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-215ENST00000582821 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 NREPQ16612 68 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 MTURNQ8N3F0 131 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 M0R2T5 61 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 PRR15Q8IV56 129 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-215ENST00000582821 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-215ENST00000582821 HRES1P13985 223 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-215ENST00000582821 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-215ENST00000582821 Q6ZVQ6 151 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-215ENST00000582821 PRO0461Q9UI25 63 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-215ENST00000582821 K7EP34 96 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-215ENST00000582821 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-215ENST00000582821 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-215ENST00000582821 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-215ENST00000582821 BPY2O14599 106 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-215ENST00000582821 K7EQZ3 153 aa7.01□□□□□ -1.29
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GGA3-215ENST00000582821 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
GGA3-215ENST00000582821 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-215ENST00000582821 hDV103S1A0JD37 113 aa6.99□□□□□ -1.29
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GGA3-215ENST00000582821 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.92□□□□□ -1.3
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GGA3-215ENST00000582821 Q8N9L7 120 aa6.9□□□□□ -1.3
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GGA3-215ENST00000582821 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.88□□□□□ -1.31
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GGA3-215ENST00000582821 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-215ENST00000582821 MT1FP04733 61 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-215ENST00000582821 ACYP1P07311 99 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-215ENST00000582821 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-215ENST00000582821 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-215ENST00000582821 KRTAP10-10P60014 251 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-215ENST00000582821 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-215ENST00000582821 A0A1B0GV90 55 aa6.69□□□□□ -1.34
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GGA3-215ENST00000582821 USH2AO75445 5202 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-215ENST00000582821 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-215ENST00000582821 LCE2BO14633 110 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-215ENST00000582821 SSPOA2VEC9 5147 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-215ENST00000582821 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-215ENST00000582821 LINC00643Q86TS7 51 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-215ENST00000582821 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.58□□□□□ -1.36
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GGA3-215ENST00000582821 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.57□□□□□ -1.36
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GGA3-215ENST00000582821 A0A087WVE0 104 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-215ENST00000582821 ATOX1O00244 68 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-215ENST00000582821 C5orf47Q569G3 176 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-215ENST00000582821 CSAG1Q6PB30 78 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-215ENST00000582821 LCA10Q71F78 164 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-215ENST00000582821 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.47□□□□□ -1.37
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GGA3-215ENST00000582821 J3QR89 54 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-215ENST00000582821 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GGA3-215ENST00000582821 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.43□□□□□ -1.38
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GGA3-215ENST00000582821 OCR1Q9BZK8 76 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-215ENST00000582821 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
GGA3-215ENST00000582821 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.37□□□□□ -1.39
GGA3-215ENST00000582821 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.37□□□□□ -1.39
GGA3-215ENST00000582821 LINC00208Q96KT6 92 aa6.37□□□□□ -1.39
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