RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514050.6

RASGEF1B-211, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 537 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-211ENST00000514050 A8MUU9 505 aa12.79□□□□□ -0.36
RASGEF1B-211ENST00000514050 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa12.78□□□□□ -0.36
RASGEF1B-211ENST00000514050 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa12.78□□□□□ -0.36
RASGEF1B-211ENST00000514050 A0A1B0GVX0 72 aa12.75□□□□□ -0.37
RASGEF1B-211ENST00000514050 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RASGEF1B-211ENST00000514050 K7EP34 96 aa12.74□□□□□ -0.37
RASGEF1B-211ENST00000514050 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa12.74□□□□□ -0.37
RASGEF1B-211ENST00000514050 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa12.72□□□□□ -0.37
RASGEF1B-211ENST00000514050 C8orf87E5RJ46 101 aa12.72□□□□□ -0.37
RASGEF1B-211ENST00000514050 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
RASGEF1B-211ENST00000514050 NREPQ16612 68 aa12.71□□□□□ -0.37
RASGEF1B-211ENST00000514050 NDUFB1O75438 58 aa12.69□□□□□ -0.38
RASGEF1B-211ENST00000514050 PRO0461Q9UI25 63 aa12.68□□□□□ -0.38
RASGEF1B-211ENST00000514050 A8MWP4 228 aa12.65□□□□□ -0.38
RASGEF1B-211ENST00000514050 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa12.65□□□□□ -0.38
RASGEF1B-211ENST00000514050 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa12.64□□□□□ -0.39
RASGEF1B-211ENST00000514050 LCE2CQ5TA81 110 aa12.61□□□□□ -0.39
RASGEF1B-211ENST00000514050 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.59□□□□□ -0.39
RASGEF1B-211ENST00000514050 PRR15Q8IV56 129 aa12.55□□□□□ -0.4
RASGEF1B-211ENST00000514050 C8orf17Q9NRJ1 99 aa12.55□□□□□ -0.4
RASGEF1B-211ENST00000514050 F8W1H4 67 aa12.54□□□□□ -0.4
RASGEF1B-211ENST00000514050 BPY2O14599 106 aa12.5□□□□□ -0.41
RASGEF1B-211ENST00000514050 COX6B2Q6YFQ2 88 aa12.49□□□□□ -0.41
RASGEF1B-211ENST00000514050 Q6ZVQ6 151 aa12.49□□□□□ -0.41
RASGEF1B-211ENST00000514050 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RASGEF1B-211ENST00000514050 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa12.45□□□□□ -0.42
RASGEF1B-211ENST00000514050 K7EQZ3 153 aa12.45□□□□□ -0.42
RASGEF1B-211ENST00000514050 MT1HP80294 61 aa12.44□□□□□ -0.42
RASGEF1B-211ENST00000514050 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa12.42□□□□□ -0.42
RASGEF1B-211ENST00000514050 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
RASGEF1B-211ENST00000514050 LINC00846Q9NV44 126 aa12.42□□□□□ -0.42
RASGEF1B-211ENST00000514050 ETDBQ3ZM63 59 aa12.41□□□□□ -0.42
RASGEF1B-211ENST00000514050 UBL5Q9BZL1 73 aa12.41□□□□□ -0.42
RASGEF1B-211ENST00000514050 TMEM254Q8TBM7 123 aa12.39□□□□□ -0.43
RASGEF1B-211ENST00000514050 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
RASGEF1B-211ENST00000514050 hDV103S1A0JD37 113 aa12.36□□□□□ -0.43
RASGEF1B-211ENST00000514050 Q8N9L7 120 aa12.31□□□□□ -0.44
RASGEF1B-211ENST00000514050 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
RASGEF1B-211ENST00000514050 M0R2T5 61 aa12.27□□□□□ -0.45
RASGEF1B-211ENST00000514050 HRES1P13985 223 aa12.27□□□□□ -0.45
RASGEF1B-211ENST00000514050 NDUFS5O43920 106 aa12.25□□□□□ -0.45
RASGEF1B-211ENST00000514050 SPINK7P58062 85 aa12.25□□□□□ -0.45
RASGEF1B-211ENST00000514050 CASC2Q6XLA1 102 aa12.24□□□□□ -0.45
RASGEF1B-211ENST00000514050 MPLKIPQ8TAP9 179 aa12.24□□□□□ -0.45
RASGEF1B-211ENST00000514050 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa12.24□□□□□ -0.45
RASGEF1B-211ENST00000514050 WFDC13Q8IUB5 93 aa12.23□□□□□ -0.45
RASGEF1B-211ENST00000514050 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa12.19□□□□□ -0.46
RASGEF1B-211ENST00000514050 FAM236CP0DP71 79 aa12.19□□□□□ -0.46
RASGEF1B-211ENST00000514050 CXCL6P80162 114 aa12.17□□□□□ -0.46
RASGEF1B-211ENST00000514050 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
RASGEF1B-211ENST00000514050 HCG22E2RYF7 251 aa12.15□□□□□ -0.46
RASGEF1B-211ENST00000514050 ACYP1P07311 99 aa12.15□□□□□ -0.46
RASGEF1B-211ENST00000514050 A0A1B0GV90 55 aa12.14□□□□□ -0.47
RASGEF1B-211ENST00000514050 LORP23490 312 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RASGEF1B-211ENST00000514050 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RASGEF1B-211ENST00000514050 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa12.1□□□□□ -0.47
RASGEF1B-211ENST00000514050 Q5W150 140 aa12.07□□□□□ -0.48
RASGEF1B-211ENST00000514050 FSIP2Q5CZC0 6907 aa11.99□□□□□ -0.49
RASGEF1B-211ENST00000514050 CRCT1Q9UGL9 99 aa11.99□□□□□ -0.49
RASGEF1B-211ENST00000514050 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa11.98□□□□□ -0.49
RASGEF1B-211ENST00000514050 IGKV2-30P06310 120 aa11.98□□□□□ -0.49
RASGEF1B-211ENST00000514050 C7orf65Q6ZTY9 151 aa11.98□□□□□ -0.49
RASGEF1B-211ENST00000514050 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa11.97□□□□□ -0.49
RASGEF1B-211ENST00000514050 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa11.94□□□□□ -0.5
RASGEF1B-211ENST00000514050 LINC00643Q86TS7 51 aa11.86□□□□□ -0.51
RASGEF1B-211ENST00000514050 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RASGEF1B-211ENST00000514050 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa11.83□□□□□ -0.52
RASGEF1B-211ENST00000514050 J3QR89 54 aa11.79□□□□□ -0.52
RASGEF1B-211ENST00000514050 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa11.79□□□□□ -0.52
RASGEF1B-211ENST00000514050 C4orf26Q17RF5 130 aa11.74□□□□□ -0.53
RASGEF1B-211ENST00000514050 A0A087WVE0 104 aa11.7□□□□□ -0.54
RASGEF1B-211ENST00000514050 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.69□□□□□ -0.54
RASGEF1B-211ENST00000514050 MT2AP02795 61 aa11.68□□□□□ -0.54
RASGEF1B-211ENST00000514050 UQCRQO14949 82 aa11.65□□□□□ -0.54
RASGEF1B-211ENST00000514050 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa11.61□□□□□ -0.55
RASGEF1B-211ENST00000514050 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa11.6□□□□□ -0.55
RASGEF1B-211ENST00000514050 MT1FP04733 61 aa11.59□□□□□ -0.55
RASGEF1B-211ENST00000514050 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.58□□□□□ -0.56
RASGEF1B-211ENST00000514050 KRTAP10-10P60014 251 aa11.57□□□□□ -0.56
RASGEF1B-211ENST00000514050 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa11.57□□□□□ -0.56
RASGEF1B-211ENST00000514050 ATOX1O00244 68 aa11.56□□□□□ -0.56
RASGEF1B-211ENST00000514050 H0Y9P7 68 aa11.55□□□□□ -0.56
RASGEF1B-211ENST00000514050 K7ERU9 68 aa11.47□□□□□ -0.57
RASGEF1B-211ENST00000514050 OCR1Q9BZK8 76 aa11.47□□□□□ -0.57
RASGEF1B-211ENST00000514050 S4R3F8 94 aa11.45□□□□□ -0.58
RASGEF1B-211ENST00000514050 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa11.44□□□□□ -0.58
RASGEF1B-211ENST00000514050 MP68P56378 58 aa11.4□□□□□ -0.58
RASGEF1B-211ENST00000514050 LINC00208Q96KT6 92 aa11.39□□□□□ -0.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 SCGB1A1P11684 91 aa11.38□□□□□ -0.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 C5orf47Q569G3 176 aa11.38□□□□□ -0.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 IMUPQ9GZP8 106 aa11.38□□□□□ -0.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 LCA10Q71F78 164 aa11.36□□□□□ -0.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 USH2AO75445 5202 aa11.36□□□□□ -0.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 CSAG1Q6PB30 78 aa11.34□□□□□ -0.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 MT-ATP8P03928 68 aa11.32□□□□□ -0.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 LCE2BO14633 110 aa11.31□□□□□ -0.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 H3BPC8 53 aa11.28□□□□□ -0.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 KLKP1Q107X0 134 aa11.28□□□□□ -0.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.23□□□□□ -0.61
RASGEF1B-211ENST00000514050 A8MUN3 132 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms