RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 J3KT08 172 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 M0R143 59 aa11.74□□□□□ -0.53
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q6ZQT0 140 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HRES1P13985 223 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa11.71□□□□□ -0.53
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDE6GP18545 87 aa11.6□□□□□ -0.55
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 C14orf132Q9NPU4 83 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPINK7P58062 85 aa11.57□□□□□ -0.56
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 C8orf17Q9NRJ1 99 aa11.57□□□□□ -0.56
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRR15Q8IV56 129 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MT1FP04733 61 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP10-10P60014 251 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USH2AO75445 5202 aa11.41□□□□□ -0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WFDC13Q8IUB5 93 aa11.41□□□□□ -0.58
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.37□□□□□ -0.59
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa11.36□□□□□ -0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H3BT86 120 aa11.36□□□□□ -0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1W2PPM0 123 aa11.33□□□□□ -0.6
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 K7EQZ3 153 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NDUFS5O43920 106 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSPOA2VEC9 5147 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCE2BO14633 110 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAX1BP3O14907 124 aa11.31□□□□□ -0.6
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa11.17□□□□□ -0.62
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa11.17□□□□□ -0.62
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.66□□□□□ -0.7
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa10.49□□□□□ -0.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPRR2GQ9BYE4 73 aa10.48□□□□□ -0.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MT1BP07438 61 aa10.47□□□□□ -0.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa10.47□□□□□ -0.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.47□□□□□ -0.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLKP1Q107X0 134 aa10.45□□□□□ -0.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A6NN06 94 aa10.44□□□□□ -0.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa10.44□□□□□ -0.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A087WVE0 104 aa10.42□□□□□ -0.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10.42□□□□□ -0.74
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