RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477941.2

PDE4DIP-212, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4DIP, Length 586 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-212ENST00000477941 HSD52Q0P140 79 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4DIP-212ENST00000477941 VPS25Q9BRG1 176 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 A0A1B0GVX0 72 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 UBE2V1Q13404 147 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 C8orf87E5RJ46 101 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 MTURNQ8N3F0 131 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 PYY3Q5JQD4 70 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 DSCR8Q96T75 97 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4DIP-212ENST00000477941 SPINK7P58062 85 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4DIP-212ENST00000477941 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4DIP-212ENST00000477941 J3KT08 172 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4DIP-212ENST00000477941 C9JAW5 83 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q6ZQT0 140 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4DIP-212ENST00000477941 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4DIP-212ENST00000477941 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4DIP-212ENST00000477941 NDUFB1O75438 58 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4DIP-212ENST00000477941 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4DIP-212ENST00000477941 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4DIP-212ENST00000477941 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4DIP-212ENST00000477941 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4DIP-212ENST00000477941 A8MWP4 228 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4DIP-212ENST00000477941 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 LINC00846Q9NV44 126 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q6ZVQ6 151 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 ATXN8Q156A1 80 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 A0A1B0GW54 56 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 PDE6GP18545 87 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 PRR15Q8IV56 129 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4DIP-212ENST00000477941 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4DIP-212ENST00000477941 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4DIP-212ENST00000477941 M0R143 59 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4DIP-212ENST00000477941 NREPQ16612 68 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4DIP-212ENST00000477941 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4DIP-212ENST00000477941 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4DIP-212ENST00000477941 NDUFS5O43920 106 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4DIP-212ENST00000477941 hDV103S1A0JD37 113 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4DIP-212ENST00000477941 K7EQZ3 153 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4DIP-212ENST00000477941 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4DIP-212ENST00000477941 IGKV2-30P06310 120 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4DIP-212ENST00000477941 NEBP20929 6669 aa6.09□□□□□ -1.43
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q5W150 140 aa6.08□□□□□ -1.44
PDE4DIP-212ENST00000477941 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.08□□□□□ -1.44
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.07□□□□□ -1.44
PDE4DIP-212ENST00000477941 BPY2O14599 106 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4DIP-212ENST00000477941 BATFQ16520 125 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q8N9L7 120 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4DIP-212ENST00000477941 H3BT86 120 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4DIP-212ENST00000477941 C4orf26Q17RF5 130 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4DIP-212ENST00000477941 CASC2Q6XLA1 102 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4DIP-212ENST00000477941 HCG22E2RYF7 251 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4DIP-212ENST00000477941 TSTD3H0UI37 97 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4DIP-212ENST00000477941 SMIM6P0DI80 62 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4DIP-212ENST00000477941 C5orf47Q569G3 176 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4DIP-212ENST00000477941 C9orf118A6NHY6 69 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4DIP-212ENST00000477941 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-212ENST00000477941 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-212ENST00000477941 CXCL6P80162 114 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-212ENST00000477941 A0A1W2PPM0 123 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-212ENST00000477941 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-212ENST00000477941 TAX1BP3O14907 124 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-212ENST00000477941 A6NN06 94 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-212ENST00000477941 MT1BP07438 61 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4DIP-212ENST00000477941 S4R3F8 94 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4DIP-212ENST00000477941 CSAG1Q6PB30 78 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q5VV11 94 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4DIP-212ENST00000477941 LCA10Q71F78 164 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4DIP-212ENST00000477941 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4DIP-212ENST00000477941 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PDE4DIP-212ENST00000477941 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4DIP-212ENST00000477941 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4DIP-212ENST00000477941 UBL5Q9BZL1 73 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRTAP10-5P60370 271 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4DIP-212ENST00000477941 KLKP1Q107X0 134 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4DIP-212ENST00000477941 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4DIP-212ENST00000477941 PRO0461Q9UI25 63 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4DIP-212ENST00000477941 MDN1Q9NU22 5596 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4DIP-212ENST00000477941 KMT2DO14686 5537 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4DIP-212ENST00000477941 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4DIP-212ENST00000477941 K7EP34 96 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4DIP-212ENST00000477941 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4DIP-212ENST00000477941 A0A087WVE0 104 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRTAP5-9P26371 169 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4DIP-212ENST00000477941 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4DIP-212ENST00000477941 IMUPQ9GZP8 106 aa5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms