RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf118	A6NHY6	69 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SSR4-208	ENST00000471880		J3KT08	172 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SSR4-208	ENST00000471880	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFB1	O75438	58 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SSR4-208	ENST00000471880	MTURN	Q8N3F0	131 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SSR4-208	ENST00000471880	C8orf87	E5RJ46	101 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SSR4-208	ENST00000471880	PDE6G	P18545	87 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPM0	123 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SSR4-208	ENST00000471880	TAX1BP3	O14907	124 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SSR4-208	ENST00000471880	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SSR4-208	ENST00000471880	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SSR4-208	ENST00000471880		H3BT86	120 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SSR4-208	ENST00000471880	FAM236C	P0DP71	79 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SSR4-208	ENST00000471880	NREP	Q16612	68 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SSR4-208	ENST00000471880	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GW54	56 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SSR4-208	ENST00000471880	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SSR4-208	ENST00000471880	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SSR4-208	ENST00000471880		A8MWP4	228 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SSR4-208	ENST00000471880	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SSR4-208	ENST00000471880	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SSR4-208	ENST00000471880	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SSR4-208	ENST00000471880	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZVQ6	151 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SSR4-208	ENST00000471880	PRR15	Q8IV56	129 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SSR4-208	ENST00000471880	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFS5	O43920	106 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SSR4-208	ENST00000471880	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SSR4-208	ENST00000471880	BPY2	O14599	106 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SSR4-208	ENST00000471880	HRES1	P13985	223 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SSR4-208	ENST00000471880		K7EQZ3	153 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880	SPINK7	P58062	85 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880		K7EP34	96 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880	hDV103S1	A0JD37	113 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N9L7	120 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SSR4-208	ENST00000471880	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SSR4-208	ENST00000471880	UBL5	Q9BZL1	73 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SSR4-208	ENST00000471880	PRO0461	Q9UI25	63 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SSR4-208	ENST00000471880	CASC2	Q6XLA1	102 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00846	Q9NV44	126 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SSR4-208	ENST00000471880	HCG22	E2RYF7	251 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV2-30	P06310	120 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SSR4-208	ENST00000471880		F8W1H4	67 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSR4-208	ENST00000471880	ETDB	Q3ZM63	59 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SSR4-208	ENST00000471880		Q5W150	140 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SSR4-208	ENST00000471880	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SSR4-208	ENST00000471880	MT2A	P02795	61 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP10-10	P60014	251 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SSR4-208	ENST00000471880	CXCL6	P80162	114 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SSR4-208	ENST00000471880	MT1F	P04733	61 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SSR4-208	ENST00000471880	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SSR4-208	ENST00000471880	C4orf26	Q17RF5	130 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SSR4-208	ENST00000471880	USH2A	O75445	5202 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SSR4-208	ENST00000471880	SSPO	A2VEC9	5147 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SSR4-208	ENST00000471880	LCE2B	O14633	110 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SSR4-208	ENST00000471880	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SSR4-208	ENST00000471880	ACYP1	P07311	99 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
SSR4-208	ENST00000471880	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SSR4-208	ENST00000471880	C5orf47	Q569G3	176 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SSR4-208	ENST00000471880	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GV90	55 aa		7	□□□□□ -1.29
SSR4-208	ENST00000471880		S4R3F8	94 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SSR4-208	ENST00000471880	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WVE0	104 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		6.92	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880		H0Y9P7	68 aa		6.92	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00643	Q86TS7	51 aa		6.92	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	CSAG1	Q6PB30	78 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	LCA10	Q71F78	164 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	UQCRQ	O14949	82 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SSR4-208	ENST00000471880	ATOX1	O00244	68 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SSR4-208	ENST00000471880		J3QR89	54 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00208	Q96KT6	92 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SSR4-208	ENST00000471880	MP68	P56378	58 aa		6.79	□□□□□ -1.32

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