RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 S100A7P31151 101 aa-3.47□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 KRTDAPP60985 99 aa-3.47□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-3.47□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 PAGE5Q96GU1 130 aa-3.47□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-3.47□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 GUCA1BQ9UMX6 200 aa-3.47□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 H0YGX0 51 aa-3.48□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 PSMD11O00231 422 aa-3.48□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-3.48□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 SCGB1D2O95969 90 aa-3.48□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 CALML3P27482 149 aa-3.48□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP-3.48□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-3.48□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa-3.48□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 PRAP1Q96NZ9 151 aa-3.48□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 VAMP8Q9BV40 100 aa-3.48□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 C3orf14Q9HBI5 128 aa-3.48□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 PAGE4O60829 102 aa-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 S100BP04271 92 aaPredicted RBP-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 GSTA1P08263 222 aa-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 NBEAP1P0C6P0 100 aa-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 UQCRBP14927 111 aa-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 MYL12AP19105 171 aa-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 PPP1R2P41236 205 aa-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 HMGN3Q15651 99 aa-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 SPANXN3Q5MJ09 141 aa-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 LINC01545Q5VT33 79 aa-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 TSC22D3Q99576 134 aa-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP-3.49□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 C11orf98E9PRG8 122 aa-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 GABARAPH6UMI1 98 aa-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H2BJP06899 126 aa-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 CKS2P33552 79 aa-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 AIF1P55008 147 aa-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 HIST2H2BEQ16778 126 aa-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 ETFRF1Q6IPR1 90 aa-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 C4orf50Q6ZRC1 276 aa-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 CALML5Q9NZT1 146 aa-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 UQCR10Q9UDW1 63 aa-3.5□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa-3.51□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 S100GP29377 79 aa-3.51□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H2BDP58876 126 aa-3.51□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 C5orf46Q6UWT4 87 aa-3.51□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 CFL2Q9Y281 166 aa-3.51□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 SYCE1LA8MT33 242 aa-3.52□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP-3.52□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 CATR1Q13166 79 aa-3.52□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 DNAL1Q4LDG9 190 aa-3.52□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 COX8CQ7Z4L0 72 aa-3.52□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 MYLPFQ96A32 169 aa-3.52□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 TOMM6Q96B49 74 aa-3.52□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP-3.52□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa-3.53□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-3.53□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 K7ERJ3 54 aa-3.53□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 LCN1P31025 176 aa-3.53□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 SPTSSAQ969W0 71 aa-3.53□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 DYDC2Q96IM9 177 aa-3.53□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 ANAPC13Q9BS18 74 aa-3.53□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC113Q9H0I3 377 aa-3.53□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 MED31Q9Y3C7 131 aa-3.53□□□□□ -2.97
SNORD54-201ENST00000459159 COX6CP09669 75 aa-3.54□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 MS4A6EQ96DS6 147 aa-3.54□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC42Q96M95 316 aa-3.54□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 MANBALQ9NQG1 85 aa-3.54□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 PLNP26678 52 aa-3.55□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 SPANXN2Q5MJ10 180 aa-3.55□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H2BMQ99879 126 aa-3.55□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa-3.55□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H2BOP23527 126 aa-3.56□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H2BBP33778 126 aa-3.56□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP-3.56□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-3.56□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H2BHQ93079 126 aa-3.56□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 PFDN5Q99471 154 aa-3.56□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H2BNQ99877 126 aa-3.56□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 MAP1LC3AQ9H492 121 aa-3.56□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 PRO1854Q9UHT4 67 aa-3.56□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 COMMD10Q9Y6G5 202 aa-3.56□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-3.57□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP-3.57□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 MYL5Q02045 173 aa-3.57□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 PEA15Q15121 130 aa-3.57□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 GSTA5Q7RTV2 222 aa-3.57□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 DBIP07108 87 aaKnown RBP-3.58□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 GSTA2P09210 222 aa-3.58□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 CALM1P0DP23 149 aa-3.58□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 CALM2P0DP24 149 aa-3.58□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 CALM3P0DP25 149 aa-3.58□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 ETDBQ3ZM63 59 aa-3.58□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM8Q96KF7 97 aa-3.58□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-3.58□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP-3.58□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 GID8Q9NWU2 228 aa-3.58□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP-3.58□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1W2PRQ8 180 aa-3.59□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 C5orf58C9J3I9 102 aa-3.59□□□□□ -2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms