RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTURNQ8N3F0 131 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A1B0GW54 56 aa13□□□□□ -0.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H3BT86 120 aa13□□□□□ -0.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT1HP80294 61 aa13□□□□□ -0.33
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM236CP0DP71 79 aa12.51□□□□□ -0.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa12.51□□□□□ -0.41
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa11.95□□□□□ -0.5
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa11.9□□□□□ -0.5
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.8□□□□□ -0.52
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 UQCRQO14949 82 aa11.73□□□□□ -0.53
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 S4R3F8 94 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C5orf47Q569G3 176 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H0Y9P7 68 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 J3QR89 54 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCA10Q71F78 164 aa11.65□□□□□ -0.54
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 CSAG1Q6PB30 78 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00208Q96KT6 92 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLKP1Q107X0 134 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MP68P56378 58 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa11.42□□□□□ -0.58
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa11.37□□□□□ -0.59
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