RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.33	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873		A0A0U1RQV1	116 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.32	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873		Q6ZRP5	223 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873		A0A0J9YXV3	536 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	BCE1	O60756	84 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873		Q8IZM0	81 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	LITAF	Q99732	161 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	HERC1	Q15751	4861 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873		A0A087WVE0	104 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	NDUFC1	O43677	76 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873		A0A1W2PNN7	141 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	UBE2B	P63146	152 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873		A0A0U1RRA0	63 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873		H7BZZ5	65 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873		H0YGX0	51 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	CD164	Q04900	197 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873		F8WEM9	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	CCK	P06307	115 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACER3-213	ENST00000533873		H0Y9J4	135 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	COX17	Q14061	63 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	NCR3	O14931	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF861P	O60384	105 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	UBE2A	P49459	152 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00158	P58513	81 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-213	ENST00000533873	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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