RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490140.1

FDPS-215, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene FDPS, Length 680 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-215ENST00000490140 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 SCGB1A1P11684 91 aa6.33□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 C6orf99Q4VX62 202 aa6.33□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.33□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 A0A1B0GV72 72 aa6.32□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 TCL1BO95988 128 aa6.32□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 A0A1B0GWB2 263 aa6.31□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 SPATA45Q537H7 98 aa6.31□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 MTURNQ8N3F0 131 aa6.31□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 LITAFQ99732 161 aa6.31□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.31□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 ZNF815PA8K554 130 aa6.3□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 C1orf195Q5TG92 126 aa6.3□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 VPS25Q9BRG1 176 aa6.29□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.29□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.28□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 F8WEM9 126 aa6.28□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 SMIM29Q86T20 159 aa6.28□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 ATOH7Q8N100 152 aa6.28□□□□□ -1.4
FDPS-215ENST00000490140 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.27□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.27□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 K7ERU9 68 aa6.26□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.26□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 A6NDN8 102 aa6.25□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 IFITM1P13164 125 aa6.25□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 Q6ZVH6 145 aa6.25□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 COX8AP10176 69 aa6.23□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.23□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.22□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 UBE2V1Q13404 147 aa6.22□□□□□ -1.41
FDPS-215ENST00000490140 Q6JHZ5 121 aa6.21□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 VAMP3Q15836 100 aa6.2□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 PCP2Q8IVA1 136 aa6.2□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 CFC1P0CG37 223 aa6.19□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 Q6Q795 121 aa6.19□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 CLEC2BQ92478 149 aa6.19□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.19□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 Q75L30 129 aa6.18□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 A0A0G2JQZ4 141 aa6.17□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.17□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 HIGD1BQ9P298 99 aa6.17□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.16□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.16□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.16□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 HSD52Q0P140 79 aa6.15□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.15□□□□□ -1.42
FDPS-215ENST00000490140 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.13□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 hADV29S1A0JD25 119 aa6.13□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 Q6ZQY7 126 aa6.13□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.13□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.13□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 LST1O00453 97 aa6.12□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 LINC00575Q6W349 94 aa6.12□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.12□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 BATFQ16520 125 aa6.11□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 IGFL1Q6UW32 110 aa6.11□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 HIST1H4GQ99525 98 aa6.1□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.09□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 Q96NJ1 140 aa6.09□□□□□ -1.43
FDPS-215ENST00000490140 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.08□□□□□ -1.44
FDPS-215ENST00000490140 SNCGO76070 127 aa6.08□□□□□ -1.44
FDPS-215ENST00000490140 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
FDPS-215ENST00000490140 CEND1Q8N111 149 aa6.07□□□□□ -1.44
FDPS-215ENST00000490140 SIGMAR1Q99720 223 aa6.07□□□□□ -1.44
FDPS-215ENST00000490140 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.05□□□□□ -1.44
FDPS-215ENST00000490140 J3QR89 54 aa6.04□□□□□ -1.44
FDPS-215ENST00000490140 C5orf47Q569G3 176 aa6.04□□□□□ -1.44
FDPS-215ENST00000490140 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.02□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 A8MUU9 505 aa6.02□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 GHRHP01286 108 aa6.02□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 FAM236CP0DP71 79 aa6.02□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.02□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 TEN1Q86WV5 123 aa6.02□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 H3BUT2 72 aa6.01□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 FXYD2P54710 66 aa6.01□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.99□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 RAB37Q96AX2 223 aa5.99□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 A0A0B4J2C4 111 aa5.98□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.98□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 USH2AO75445 5202 aa5.98□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 SSPOA2VEC9 5147 aa5.97□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 A0A087WSZ3 146 aa5.97□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 C9orf118A6NHY6 69 aa5.97□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 TAX1BP3O14907 124 aa5.97□□□□□ -1.45
FDPS-215ENST00000490140 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
FDPS-215ENST00000490140 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.96□□□□□ -1.46
FDPS-215ENST00000490140 H0YGX0 51 aa5.95□□□□□ -1.46
FDPS-215ENST00000490140 FABP2P12104 132 aa5.95□□□□□ -1.46
FDPS-215ENST00000490140 K7ERJ3 54 aa5.94□□□□□ -1.46
FDPS-215ENST00000490140 A0A1W2PPM0 123 aa5.93□□□□□ -1.46
FDPS-215ENST00000490140 DSCR10P59022 87 aa5.93□□□□□ -1.46
FDPS-215ENST00000490140 LINC00313P59037 77 aa5.93□□□□□ -1.46
FDPS-215ENST00000490140 LINC00846Q9NV44 126 aa5.93□□□□□ -1.46
FDPS-215ENST00000490140 H3BMG7 143 aa5.92□□□□□ -1.46
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