RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 ITPR2Q14571 2701 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 K7EQZ3 153 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 ACYP2P14621 99 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 IGFL1Q6UW32 110 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 Q96NJ1 140 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 C1orf195Q5TG92 126 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 A8MWP4 228 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 APLNQ9ULZ1 77 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 H3BPC8 53 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 A0A0G2JQZ4 141 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PNN7 141 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 BSNQ9UPA5 3926 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.66□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.66□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 HIVEP1P15822 2718 aa8.66□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1B0GU69 56 aa8.66□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HDLBP-241ENST00000487169 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.65□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 C8orf87E5RJ46 101 aa8.64□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 J3QL48 77 aa8.64□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.64□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.64□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.64□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 ERC2-IT1O76042 136 aa8.63□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.61□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 PRR15Q8IV56 129 aa8.61□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.61□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.61□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 PRO0628Q9UI54 55 aa8.6□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV7-43P04211 117 aa8.59□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 ZANQ9Y493 2812 aa8.59□□□□□ -1.03
HDLBP-241ENST00000487169 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 TENM4Q6N022 2769 aa8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 WIPF1O43516 503 aa8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 DSCR10P59022 87 aa8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PNM2 257 aa8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 TNP2Q05952 138 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 SPRR4Q96PI1 79 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1B0GVX0 72 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 OXTP01178 125 aa8.54□□□□□ -1.04
HDLBP-241ENST00000487169 H7BZZ5 65 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-241ENST00000487169 Q5XG85 94 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-241ENST00000487169 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-241ENST00000487169 C9orf92A6NGG3 77 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-241ENST00000487169 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.49□□□□□ -1.052e-6■□□□□ 10.8
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-241ENST00000487169 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-241ENST00000487169 KLKP1Q107X0 134 aa8.46□□□□□ -1.05
HDLBP-241ENST00000487169 COA5Q86WW8 74 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-241ENST00000487169 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-241ENST00000487169 A8MUN3 132 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-241ENST00000487169 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-241ENST00000487169 NF1P21359 2839 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-241ENST00000487169 FBN2P35556 2912 aa8.36□□□□□ -1.07
HDLBP-241ENST00000487169 UQCR11O14957 56 aa8.35□□□□□ -1.07
HDLBP-241ENST00000487169 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HDLBP-241ENST00000487169 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.34□□□□□ -1.07
HDLBP-241ENST00000487169 APCP25054 2843 aa8.33□□□□□ -1.08
HDLBP-241ENST00000487169 Q8NDZ9 215 aa8.33□□□□□ -1.08
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.31□□□□□ -1.08
HDLBP-241ENST00000487169 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.3□□□□□ -1.08
HDLBP-241ENST00000487169 TENM3Q9P273 2699 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-241ENST00000487169 Q8N1X5 172 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-241ENST00000487169 VPS13CQ709C8 3753 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-241ENST00000487169 SPRR1AP35321 89 aa8.27□□□□□ -1.08
HDLBP-241ENST00000487169 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.27□□□□□ -1.08
HDLBP-241ENST00000487169 CD164Q04900 197 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-241ENST00000487169 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-241ENST00000487169 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-241ENST00000487169 OCR1Q9BZK8 76 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-241ENST00000487169 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-241ENST00000487169 CUBNO60494 3623 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-241ENST00000487169 ZFHX3Q15911 3703 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-241ENST00000487169 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-241ENST00000487169 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZSA8 131 aa8.18□□□□□ -1.1
HDLBP-241ENST00000487169 LINC01554Q52M75 96 aa8.18□□□□□ -1.1
HDLBP-241ENST00000487169 SPRR1BP22528 89 aa8.15□□□□□ -1.1
HDLBP-241ENST00000487169 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-241ENST00000487169 A0A0D9SG42 100 aa8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-2P60368 255 aa8.11□□□□□ -1.11
HDLBP-241ENST00000487169 HRES1P13985 223 aa8.11□□□□□ -1.11
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-1P60331 282 aa8.11□□□□□ -1.11
HDLBP-241ENST00000487169 LCE6AA0A183 80 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-241ENST00000487169 CRIPTQ9P021 101 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.09□□□□□ -1.11
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