RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 SCXQ7RTU7 201 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 PRLHP81277 87 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 CHTF8P0CG12 524 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 KLKP1Q107X0 134 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 RYR2Q92736 4967 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 SEC61GP60059 68 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 IGFL1Q6UW32 110 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZR54 194 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 A0A087WTM6 91 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2AP49459 152 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 C5orf47Q569G3 176 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 RYR3Q15413 4870 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 C20orf197Q8N268 126 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 TENM2Q9NT68 2774 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 OCR1Q9BZK8 76 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 DSCR10P59022 87 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 Q8N9L7 120 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 PANO1I0J062 215 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFC1O43677 76 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 J3KT08 172 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRF-212ENST00000477970 H7BZZ5 65 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 DPH3Q96FX2 82 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 LY6G6CO95867 125 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00483Q53H64 154 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 RTL8CO15255 209 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 K7EQZ3 153 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 A0A087WSZ3 146 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0U1RQV1 116 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 FAM236CP0DP71 79 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRF-212ENST00000477970 KMT2AQ03164 3969 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH2Q9P225 4427 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 HCG22E2RYF7 251 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0G2JQZ4 141 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 SNURFQ9Y675 71 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRF-212ENST00000477970 A8MWP4 228 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF861PO60384 105 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 C4orf26Q17RF5 130 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 PRR15Q8IV56 129 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 OXTP01178 125 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 Q96NJ1 140 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1B0GVY2 172 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV7-43P04211 117 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 CASC2Q6XLA1 102 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 H3BPC8 53 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFB1O75438 58 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZSA8 131 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 PKD1P98161 4303 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 CD164Q04900 197 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 MOBPQ13875 183 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRF-212ENST00000477970 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 MP68P56378 58 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 Q5XG85 94 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP10-2P60368 255 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 hDV103S1A0JD37 113 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.24□□□□□ -1.25
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