RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 DEFB106AQ8N104 65 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 WFDC6Q9BQY6 131 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 F5P12259 2224 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 WNK1Q9H4A3 2382 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 KNTC1P50748 2209 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 FXYD1O00168 92 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 CFAP126Q5VTH2 177 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC00846Q9NV44 126 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ESPL1Q14674 2120 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-207ENST00000470201 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP1.28□□□□□ -2.22e-10■■■■■ 54.3
RABGGTB-207ENST00000470201 ROS1P08922 2347 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1B0GWA3 101 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 UMAD1C9J7I0 102 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 M0R135 149 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 SMIM13P0DJ93 91 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 FXYD6P3P58550 94 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 HIGD1BQ9P298 99 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 TENM3Q9P273 2699 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 KNL1Q8NG31 2342 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 PI4KAP42356 2102 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 MXRA5Q9NR99 2828 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 FSIP2Q5CZC0 6907 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 C10orf142B7Z368 130 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 PIN1P1O15428 100 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 CCL19Q99731 98 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A087WTM6 91 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM223BA6NKX1 122 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 F8WEM9 126 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 PLGLAQ15195 96 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 DEFB121Q5J5C9 76 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM223AQ8IWN6 122 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 SMIM11BQ8TCY0 68 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC00208Q96KT6 92 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 BPESC1Q9GZL8 116 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 URB1O60287 2271 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 FAT4Q6V0I7 4981 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 SPTBP11277 2137 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 TENM2Q9NT68 2774 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A096LNT2 108 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 CEBPZOSA8MTT3 80 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 SNRPGP15A8MWD9 76 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 D6R8Y8 96 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 ARMS2P0C7Q2 107 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 COX8AP10176 69 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 SPINT3P49223 89 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 MUSTN1Q8IVN3 82 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 COX14Q96I36 57 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 SPRR4Q96PI1 79 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 MED12Q93074 2177 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 ABCA4P78363 2273 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 LEPROTL1O95214 131 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 C3orf79P0CE67 100 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 ACYP2P14621 99 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF137PP52743 207 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 SONP18583 2426 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 DOCK11Q5JSL3 2073 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFB1O75438 58 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 DEFB124Q8NES8 71 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD36A6QL64 1941 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 CSMD3Q7Z407 3707 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 SACSQ9NZJ4 4579 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-207ENST00000470201 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 IQCF6A8MYZ5 107 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 GCHFRP30047 84 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 S100A3P33764 101 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 DEFB133Q30KQ1 61 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 SFTA2Q6UW10 78 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 C6orf201Q7Z4U5 140 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 Q96NJ1 140 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 FXYD6Q9H0Q3 95 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 U3KQA8 63 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF213Q63HN8 5207 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 Q6JHZ5 121 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 PLAC4Q8WY50 150 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR15LQ9BU68 103 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 PROK2Q9HC23 129 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 HILPDAQ9Y5L2 63 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 TACC2O95359 2948 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1B0GUT8 65 aa1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 169.8 ms