RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449271.5

BBX-214, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 4

Gene BBX, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-214ENST00000449271 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 SNHG12Q9BXW3 62 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 NPCDR1Q9BY65 106 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 MED28Q9H204 178 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 ST20Q9HBF5 79 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 DIABLOQ9NR28 239 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 BATF3Q9NR55 127 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 GSKIPQ9P0R6 139 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 TMEM14CQ9P0S9 112 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 ORC6Q9Y5N6 252 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 TRAV7A0A075B6U4 112 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 IFITM5A6NNB3 132 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 DISC1C4P0D8 188 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 H0Y8G0 127 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 H3BRM9 83 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 K7EMI3 77 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 FXYD1O00168 92 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 GATCO43716 136 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 NDUFB1O75438 58 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 SFT2D2O95562 160 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 TRACP01848 142 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 HBDP02042 147 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 UCHL1P09936 223 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 FABP2P12104 132 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 IFITM1P13164 125 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 IL7P13232 177 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 MYL12AP19105 171 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 ATP6V0CP27449 155 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 CRIP1P50238 77 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 HERVK_113P63121 156 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 SEC11AP67812 179 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 PDE6HQ13956 83 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 RHEBQ15382 184 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 SPATA45Q537H7 98 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 OCIAD2Q56VL3 154 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 Q6JHZ5 121 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 Q6ZQY7 126 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 TCTE3Q8IZS6 198 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 ANKRD29Q8N6D5 301 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 OR5H6Q8NGV6 325 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 TERB2Q8NHR7 220 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 MCFD2Q8NI22 146 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 BORCS7Q96B45 105 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 SMIM3Q9BZL3 60 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 C20orf27Q9GZN8 174 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 OTORQ9NRC9 128 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 SPANXA1Q9NS26 97 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-0.03□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 EFCAB10A6NFE3 127 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 CCDC160A6NGH7 325 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 C11orf86A6NJI1 115 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 BBIP1A8MTZ0 92 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 FAM25AB3EWG3 89 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 FAM25CB3EWG5 89 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 FAM25GB3EWG6 89 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 J3KT08 172 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 K7ERS5 55 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 HPGDSO60760 199 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 PFDN1O60925 122 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 NPYP01303 97 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 CCKP06307 115 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 ACYP1P07311 99 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 G0S2P27469 103 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 GCHFRP30047 84 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 CKS2P33552 79 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 PSMB2P49721 201 aa-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 156.8 ms