RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 IAPPP10997 89 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 MINOS1Q5TGZ0 78 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 BDP1A6H8Y1 2624 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 CLTCL1P53675 1640 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 REV3LO60673 3130 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 CSPG4Q6UVK1 2322 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 NCOR1O75376 2440 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC01546A6NGU7 62 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCA2Q9BZC7 2435 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 WNK2Q9Y3S1 2297 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 AKAP6Q13023 2319 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 H0YGX0 51 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB130BP0DP73 79 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB130AP0DP74 79 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 C6orf48Q9UBA6 75 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 CHD6Q8TD26 2715 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ALMS1Q8TCU4 4167 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 SPTA1P02549 2419 aa0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 SPINK4O60575 86 aa0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00308Q8TCZ7 52 aa0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM167BQ9NRX6 74 aa0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ATRQ13535 2644 aa0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-202ENST00000370826 PCNX1Q96RV3 2341 aa0.53□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa0.53□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 GCC2Q8IWJ2 1684 aa0.53□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 VWFP04275 2813 aa0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 DSPP15924 2871 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 TFF3Q07654 80 aa0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB109BQ30KR1 87 aa0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 TRANK1O15050 2925 aa0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 DUOX1Q9NRD9 1551 aa0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP290O15078 2479 aa0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 MROH2BQ7Z745 1585 aa0.51□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.5□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.49□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.49□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.49□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 FRAS1Q86XX4 4008 aa0.48□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.48□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 WT1-ASQ06250 92 aa0.47□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB106AQ8N104 65 aa0.47□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 SMR3AQ99954 134 aa0.47□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 S4R3F8 94 aa0.47□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.47□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 NBASA2RRP1 2371 aa0.47□□□□□ -2.33
RABGGTB-202ENST00000370826 APCP25054 2843 aa0.46□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 TENM4Q6N022 2769 aa0.46□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 AKAP13Q12802 2813 aa0.46□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 SPINK6Q6UWN8 80 aa0.46□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 TNXBP22105 4242 aa0.46□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 CREBBPQ92793 2442 aa0.45□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 CSMD3Q7Z407 3707 aa0.45□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 WFDC10BQ8IUB3 73 aa0.45□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM2Q9BVW6 85 aa0.45□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 KAAG1Q9UBP8 84 aa0.45□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 HECTD1Q9ULT8 2610 aa0.45□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFA1O15239 70 aa0.44□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PRLHP81277 87 aa0.44□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.44□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.43□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.43□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.43□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.43□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB135Q30KP9 77 aa0.42□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 ANK2Q01484 3957 aa0.42□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.41□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BUA1 57 aa0.41□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 M0R2T5 61 aa0.41□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 SPINK1P00995 79 aa0.41□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PRM1P04553 51 aa0.41□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 MUC5ACP98088 5654 aa0.41□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPN13Q12923 2485 aa0.41□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.4□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 WNK1Q9H4A3 2382 aa0.4□□□□□ -2.34
RABGGTB-202ENST00000370826 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.4□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 PDZD2O15018 2839 aa0.4□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa0.4□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 PHGR1C9JFL3 82 aa0.39□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 U3KQA8 63 aa0.39□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0C4DFX4 3053 aa0.39□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ACANP16112 2415 aa0.39□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 APC2O95996 2303 aa0.38□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 H0YGG7 62 aa0.38□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 MDN1Q9NU22 5596 aa0.37□□□□□ -2.35
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