RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC170Q8IYT3 715 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNAJC9Q8WXX5 260 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM19Q96E16 107 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NAP1L6A6NFF2 107 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FABP5P3A8MUU1 101 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OCM2P0CE71 109 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM21Q3B7S5 101 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CENPWQ5EE01 88 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MIR17HGQ75NE6 70 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MNS1Q8NEH6 495 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MS4A6EQ96DS6 147 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCL13Q99616 98 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UBL5Q9BZL1 73 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OTORQ9NRC9 128 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A087WXM4 84 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM23A6NLE4 172 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GAP43P17677 238 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CASQ1P31415 396 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PMS2P3Q13401 168 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EFCAB11Q9BUY7 163 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1W2PRE2 83 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MPC2O95563 127 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CARD18P57730 90 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSME3P61289 254 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BORCS8Q96FH0 119 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C12orf57Q99622 126 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CGREF1Q99674 301 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDCD10Q9BUL8 212 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PKIBQ9C010 78 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IQCF6A8MYZ5 107 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DPM2O94777 84 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LINC00032P0C843 101 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UCHL3P15374 230 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SDC2P34741 201 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPL31P62899 125 aaKnown RBP-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM5Q71RC9 77 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COPS4Q9BT78 406 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C1orf21Q9H246 121 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ENY2Q9NPA8 101 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM13P0DJ93 91 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 S100A7P31151 101 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SELENOWP63302 87 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HIST3H2BBQ8N257 126 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPANXDQ9BXN6 97 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCBD2Q9H0N5 130 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRPEL1Q9HAV7 217 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DKKL1Q9UK85 242 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLGLAQ15195 96 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPANXN3Q5MJ09 141 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HIST1H2BLQ99880 126 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 G3V2T6 193 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC179H3BU77 68 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 K7EIM0 57 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM45BPQ6NSW5 357 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LZTFL1Q9NQ48 299 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BLOC1S6Q9UL45 172 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERPINB1P30740 379 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM7Q9BQ49 75 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GLTPQ9NZD2 209 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CBX3Q13185 183 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 Q56UQ5 140 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CIB2O75838 187 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCEAL4Q96EI5 215 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CENPKQ9BS16 269 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM17P0DL12 118 aa-4.09□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DPY30Q9C005 99 aa-4.09□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYH16Q9H6N6 1097 aa-4.09□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SSR3Q9UNL2 185 aa-4.09□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HIGD1AQ9Y241 93 aa-4.09□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-4.09□□□□□ -3.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSPHP78330 225 aa-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OTUD6BQ8N6M0 293 aa-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COX16Q9P0S2 106 aa-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1B0GUT8 65 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GNG10P50151 68 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CAV1Q03135 178 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VAMP3Q15836 100 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MEIG1Q5JSS6 88 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa-4.12□□□□□ -3.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP5HO75947 161 aa-4.12□□□□□ -3.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.9 ms