RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDE6DO43924 150 aa-5.98□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRP19P09132 144 aaKnown RBP-5.98□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM17P0DL12 118 aa-5.98□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-5.98□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MEIG1Q5JSS6 88 aa-5.98□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VAMP8Q9BV40 100 aa-5.98□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HPF1Q9NWY4 346 aa-5.98□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-5.99□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 G0S2P27469 103 aa-5.99□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP-5.99□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SSR3Q9UNL2 185 aa-5.99□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa-5.99□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EFCAB9A8MZ26 197 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2BOP23527 126 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2BBP33778 126 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2BDP58876 126 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPS14P62263 151 aaKnown RBP-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2BCP62807 126 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST2H2BEQ16778 126 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPANXN2Q5MJ10 180 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCN4BQ8IWT1 228 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2BHQ93079 126 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TCEAL4Q96EI5 215 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2BNQ99877 126 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2BMQ99879 126 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SAR1AQ9NR31 198 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYL9P24844 172 aa-6.01□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAA20P61599 178 aa-6.01□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAV1Q03135 178 aa-6.01□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DYDC1Q8WWB3 177 aa-6.01□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AIF1P55008 147 aa-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMAGPQ0VAQ4 97 aa-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TIPINQ9BVW5 301 aa-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NPCDR1Q9BY65 106 aa-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1orf21Q9H246 121 aa-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UQCR10Q9UDW1 63 aa-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-6.03□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UMAD1C9J7I0 102 aa-6.03□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H3BP45 60 aa-6.03□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP-6.03□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPT1P13693 172 aaKnown RBP-6.03□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP-6.03□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNG10P50151 68 aa-6.03□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP-6.03□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MS4A6EQ96DS6 147 aa-6.03□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A6NDN8 102 aa-6.04□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNG7O60262 68 aa-6.04□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAPPC2P0DI81 140 aa-6.04□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-6.04□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CALB2P22676 271 aa-6.04□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP-6.04□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP-6.04□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-6.04□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COX16Q9P0S2 106 aa-6.04□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1W2PPV4 95 aa-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CKS2P33552 79 aa-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AP1S2P56377 157 aa-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H2BFSP57053 126 aa-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CPLX4Q7Z7G2 160 aa-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP1LC3AQ9H492 121 aa-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPC25Q9HBM1 224 aa-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPANXCQ9NY87 97 aa-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNTNA6NMZ2 147 aa-6.06□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C5orf58C9J3I9 102 aa-6.06□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CALUO43852 315 aaPredicted RBP-6.06□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP-6.06□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H3BVH4 76 aa-6.07□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COPZ1P61923 177 aa-6.07□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BST2Q10589 180 aaKnown RBP-6.07□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC01545Q5VT33 79 aa-6.07□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LSMEM1Q8N8F7 131 aa-6.07□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FTH1P02794 183 aa-6.08□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GUCA1BQ9UMX6 200 aa-6.08□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00587B1AMM8 73 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WRBO00258 174 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYB5AP00167 134 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCL1P22362 96 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R2P41236 205 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C10orf107Q8IVU9 208 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 S100ZQ8WXG8 99 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPANXA1Q9NS26 97 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa-6.1□□□□□ -3.39
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-6.1□□□□□ -3.39
RNU6-1128P-201ENST00000362825 K7ERJ3 54 aa-6.1□□□□□ -3.39
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTHP01270 115 aa-6.1□□□□□ -3.39
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MZT1Q08AG7 82 aa-6.1□□□□□ -3.39
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