RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	AKR1D1	P51857	326 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337		A6NN06	94 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	TCL1B	O95988	128 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q6ZVH6	145 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	NDUFA6	P56556	154 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q96NJ1	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	TAL2	Q16559	108 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPTAN1-231	ENST00000636337		A8MWP4	228 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	HRES1	P13985	223 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337		A8MUU9	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPRR2E	P22531	72 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPRR2B	P35325	72 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPRR2A	P35326	72 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	HERV-K104	P63124	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337		C9JQL5	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	NDUFC2	O95298	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	HBD	P02042	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A096LNJ9	63 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	COX7B	P24311	80 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	NPC2	P61916	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	GHRH	P01286	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	RHEB	Q15382	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPTAN1-231	ENST00000636337	PEA15	Q15121	130 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	LST1	O00453	97 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	MT1B	P07438	61 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337		F8WEM9	126 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPRR2D	P22532	72 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	DSCR10	P59022	87 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	IFITM2	Q01629	132 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q5VV11	94 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SPTAN1-231	ENST00000636337	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.46	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.46	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.46	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.45	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337	LEPROT	O15243	131 aa		4.45	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q6JHZ5	121 aa		4.45	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.45	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00614	P0C842	121 aa		4.44	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.43	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A1B0GWB2	263 aa		4.43	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337		J3QQQ9	107 aa		4.43	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337	NMU	P48645	174 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.42	□□□□□ -1.7

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