RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 VAMP8Q9BV40 100 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.73□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 H0Y9J4 135 aa6.73□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 PMAIP1Q13794 54 aa6.73□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.73□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM223A0PJW6 202 aa6.72□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 SERF1AO75920 110 aa6.72□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 LEPROTL1O95214 131 aa6.72□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 PFN2P35080 140 aa6.72□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 LINC00310P59036 64 aa6.72□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP10-8P60410 259 aa6.72□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 A6NDN8 102 aa6.71□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.71□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 A0A0A0MQY5 61 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 FAM236CP0DP71 79 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 Q6Q795 121 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 LINC00167Q96N53 147 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF861PO60384 105 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 BCE1O60756 84 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 DPM2O94777 84 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 PLNP26678 52 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 LINC00158P58513 81 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HIST1H2BKO60814 126 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HIST1H2BJP06899 126 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HIST1H2BOP23527 126 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HIST1H2BBP33778 126 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HIST1H2BDP58876 126 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HERVK_113P61574 105 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HIST1H2BCP62807 126 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-209ENST00000620074 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 IGKV2D-28P01615 120 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 IFITM1P13164 125 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 LEPROTO15243 131 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 IGKCP01834 107 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 SMIM13P0DJ93 91 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 UBE2AP49459 152 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 NMUP48645 174 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 Q8NDZ9 215 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 CCDC179H3BU77 68 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 J3QQQ9 107 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 TRIAP1O43715 76 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 A0A1B0GWB2 263 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 K7EP34 96 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 M0R378 163 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 PRYO14603 147 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 TAX1BP3O14907 124 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-209ENST00000620074 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 F8W1H4 67 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.57□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 E9PLD3 99 aa6.57□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 PRLHP81277 87 aa6.57□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 LINC01545Q5VT33 79 aa6.57□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.57□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 NCR3O14931 201 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 CRYGAP11844 174 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 Q5XG85 94 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 RAB37Q96AX2 223 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 A0A087X002 238 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM258P61165 79 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 Q6ZVH6 145 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 DAND5Q8N907 189 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.54□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.54□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.54□□□□□ -1.36
UBXN8-209ENST00000620074 LRP2P98164 4655 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms