RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 Q5XG85 94 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 SERP2Q8N6R1 65 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 COX7A2LO14548 114 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 OXTP01178 125 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 FAM168BA1KXE4 195 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 PRSS2P07478 247 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 C4orf26Q17RF5 130 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 Q6JHZ5 121 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 RMI2Q96E14 147 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 A0A096LNI7 61 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 CDK2AP2O75956 126 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 C10orf25Q5T742 122 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 A0A087WZ39 114 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 F8WDY8 70 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 TIRAPP58753 221 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 DSCR8Q96T75 97 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 Q6ZRU5 148 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 NDUFC2O95298 119 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 PRO0628Q9UI54 55 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 SS18Q15532 418 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 COPS9Q8WXC6 57 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 C22orf24Q9Y442 160 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 PFN2P35080 140 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 C15orf56Q8N910 161 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 NDUFA1O15239 70 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 UBE2BP63146 152 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 SPAG11BQ08648 103 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 NPC2P61916 151 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 DNAL4O96015 105 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PNN7 141 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 SYCNQ0VAF6 134 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 C1orf137Q5JT78 98 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 FAM236CP0DP71 79 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 FAM104AQ969W3 186 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-212ENST00000548567 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.77□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.77□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 BCE1O60756 84 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 IGKV2D-28P01615 120 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 PRR34Q9NV39 138 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 LINC00846Q9NV44 126 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 LPAP08519 4548 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 A0A087WVE0 104 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 GHRHP01286 108 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 C7orf33Q8WU49 177 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 C14orf177Q52M58 125 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 Q6ZRP5 223 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GUV1 79 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 H0YGX0 51 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85 ms