RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 B9D2Q9BPU9 175 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 UPK3BQ9BT76 320 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 VWFP04275 2813 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.52□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 CASC10Q5T4H9 136 aa3.52□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 Q6ZRU5 148 aa3.52□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 TEN1Q86WV5 123 aa3.52□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 MUC7Q8TAX7 377 aa3.52□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 APLNQ9ULZ1 77 aa3.52□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 C22orf24Q9Y442 160 aa3.52□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 TGP01266 2768 aa3.51□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.51□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 H0YGX0 51 aa3.51□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 H3BT86 120 aa3.51□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 TRACP01848 142 aa3.51□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.51□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.51□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.51□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 OCR1Q9BZK8 76 aa3.51□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 ANK2Q01484 3957 aa3.51□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 RYR3Q15413 4870 aa3.5□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.5□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 F8WDY8 70 aa3.5□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 VPS25Q9BRG1 176 aa3.5□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 Q9HAA7 133 aa3.5□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.5□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.5□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 STAB1Q9NY15 2570 aa3.5□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 COL6A5A8TX70 2615 aa3.49□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 J3QR89 54 aa3.49□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 NCR3O14931 201 aa3.49□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 IGLV6-57P01721 117 aa3.49□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.49□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 SYCNQ0VAF6 134 aa3.49□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 LINC00167Q96N53 147 aa3.49□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 TMEM126AQ9H061 195 aa3.49□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.49□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.49□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.48□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.48□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.48□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 A0A1B0GX51 115 aa3.47□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 LECT2O14960 151 aa3.47□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.47□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 RMI2Q96E14 147 aa3.47□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TRDN-205ENST00000546248 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.46□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 M0R378 163 aa3.46□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 C6orf99Q4VX62 202 aa3.46□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.46□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 LINC00575Q6W349 94 aa3.46□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 Q8N814 137 aa3.46□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.45□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 REG3GQ6UW15 175 aa3.45□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.45□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 SIGMAR1Q99720 223 aa3.45□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.44□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 DSCR10P59022 87 aa3.44□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.44□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 hADV29S1A0JD25 119 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 NUPR2A6NF83 97 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 DNAL4O96015 105 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 MT-ATP8P03928 68 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 COX7BP24311 80 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 C7orf33Q8WU49 177 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 TENM3Q9P273 2699 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 FAM168BA1KXE4 195 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 DIRC1Q969H9 104 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 NOTCH1P46531 2555 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PNN7 141 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TRDN-205ENST00000546248 PSCAO43653 123 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-205ENST00000546248 ACYP1P07311 99 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-205ENST00000546248 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-205ENST00000546248 SCGB1A1P11684 91 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-205ENST00000546248 SPRR1AP35321 89 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-205ENST00000546248 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TRDN-205ENST00000546248 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-205ENST00000546248 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRDN-205ENST00000546248 A0A096LNI7 61 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms