RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515490.1

GATB-211, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B, humanhuman

TSL 4

Gene GATB, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATB-211ENST00000515490 SPRR4Q96PI1 79 aa7.57□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 USH2AO75445 5202 aa7.56□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.56□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 TMEM223A0PJW6 202 aa7.56□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 NMUP48645 174 aa7.56□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 HERVK_113P63121 156 aa7.56□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 XP32Q5T750 250 aa7.56□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.56□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 Q8NBF4 154 aa7.56□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 HIGD1BQ9P298 99 aa7.56□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 M0R143 59 aa7.55□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 CXCL5P42830 114 aa7.55□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.55□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 PCP2Q8IVA1 136 aa7.55□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.55□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 COX7B2Q8TF08 81 aa7.55□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.54□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 LEPROTO15243 131 aa7.53□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.53□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
GATB-211ENST00000515490 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.52□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.52□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 H3BRM9 83 aa7.52□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 SPINK8P0C7L1 97 aa7.52□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 Q8N377 158 aa7.51□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.51□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.51□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 J3QQQ9 107 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 PFN2P35080 140 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 HSD52Q0P140 79 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 TAL2Q16559 108 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.48□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 ZNF815PA8K554 130 aa7.48□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.47□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.47□□□□□ -1.21
GATB-211ENST00000515490 SPINK1P00995 79 aa7.46□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 CFC1BP0CG36 223 aa7.46□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.45□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 LINC00483Q53H64 154 aa7.44□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 PCOTHQ58A44 107 aa7.44□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.44□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.43□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 CEND1Q8N111 149 aa7.43□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.43□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 ERG28Q9UKR5 140 aa7.43□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 A0A0J9YXY3 114 aa7.42□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 TIMM17BO60830 172 aa7.42□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 SPRR1AP35321 89 aa7.42□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 BATFQ16520 125 aa7.42□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 ERC2-IT1O76042 136 aa7.41□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 Q6ZVH6 145 aa7.41□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 HIST1H4GQ99525 98 aa7.41□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.4□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 A6NDN8 102 aa7.4□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 HERV-K104P63124 156 aa7.4□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 MOBPQ13875 183 aa7.4□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 SFTA2Q6UW10 78 aa7.4□□□□□ -1.22
GATB-211ENST00000515490 LCE2BO14633 110 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 A0A1B0GWB2 263 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 FXYD2P54710 66 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 LITAFQ99732 161 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 SPANXCQ9NY87 97 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.36□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.36□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 A6NJY4 79 aa7.36□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 TAX1BP3O14907 124 aa7.36□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 SMIM13P0DJ93 91 aa7.36□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 IFITM1P13164 125 aa7.36□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 COX17Q14061 63 aa7.36□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.36□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 SLC25A20O43772 301 aa7.35□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.35□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 A0A1B0GV90 55 aa7.34□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 PRYO14603 147 aa7.34□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.34□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 Q9BRP9 147 aa7.34□□□□□ -1.23
GATB-211ENST00000515490 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.33□□□□□ -1.24
GATB-211ENST00000515490 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.33□□□□□ -1.24
GATB-211ENST00000515490 COPS9Q8WXC6 57 aa7.33□□□□□ -1.24
GATB-211ENST00000515490 A0A0U1RRA0 63 aa7.32□□□□□ -1.24
GATB-211ENST00000515490 C9orf118A6NHY6 69 aa7.32□□□□□ -1.24
GATB-211ENST00000515490 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GATB-211ENST00000515490 C9orf92A6NGG3 77 aa7.31□□□□□ -1.24
GATB-211ENST00000515490 B5MCH6 92 aa7.31□□□□□ -1.24
GATB-211ENST00000515490 NCR3O14931 201 aa7.31□□□□□ -1.24
GATB-211ENST00000515490 A0A0B4J2C4 111 aa7.3□□□□□ -1.24
GATB-211ENST00000515490 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.3□□□□□ -1.24
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