RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.76□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 H7BZZ5 65 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 C6orf223Q8N319 242 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 Q8IZM0 81 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZTC4 211 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 NCR3O14931 201 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 LELP1Q5T871 98 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 CD164Q04900 197 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 KIAA0087Q14695 138 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 C10orf25Q5T742 122 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZR54 194 aa4.73□□□□□ -1.65
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HERC4-211ENST00000492996 A0A087WYN8 130 aa4.72□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 SPAG11BQ08648 103 aa4.72□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 CDK2AP2O75956 126 aa4.71□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
HERC4-211ENST00000492996 A0A0J9YWU9 116 aa4.71□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 APLNQ9ULZ1 77 aa4.71□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.71□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 LECT2O14960 151 aa4.71□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 SLPIP03973 132 aa4.71□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 UBL5Q9BZL1 73 aa4.71□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 HAMPP81172 84 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 Q8NDZ9 215 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.69□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 EPM2AB3EWF7 344 aa4.69□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.69□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 ESRGQ1W209 222 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 PRR34Q9NV39 138 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 C22orf24Q9Y442 160 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 H0YGX0 51 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 COX17Q14061 63 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 PSPHP1O15172 72 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 KLKP1Q107X0 134 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 C6orf99Q4VX62 202 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 NDUFC1O43677 76 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 PRR15Q8IV56 129 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.65□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.65□□□□□ -1.66
HERC4-211ENST00000492996 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.672e-6■■■■□ 19.5
HERC4-211ENST00000492996 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.64□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZRU5 148 aa4.63□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.63□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 Q8N814 137 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 SCXQ7RTU7 201 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 C15orf56Q8N910 161 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.61□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 FAT1Q14517 4588 aa4.61□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.61□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.61□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.61□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 NREPQ16612 68 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 H3BS24 57 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 LINC00575Q6W349 94 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 TENM2Q9NT68 2774 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 IGLV6-57P01721 117 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-211ENST00000492996 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZQY7 126 aa4.59□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 BCE1O60756 84 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 SYCNQ0VAF6 134 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZRP5 223 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 COL7A1Q02388 2944 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 PRYO14603 147 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 VPREB1P12018 145 aa4.57□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 DIRC1Q969H9 104 aa4.57□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.57□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.57□□□□□ -1.68
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