RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, human

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3A3-208	ENST00000489537	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	PDE6G	P18545	87 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537		Q6ZRU5	148 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	VPREB1	P12018	145 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537		Q8N814	137 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	PRY	O14603	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	NCR3	O14931	201 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	LECT2	O14960	151 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	COX7B	P24311	80 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	HERC2	O95714	4834 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	LCE6A	A0A183	80 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537		Q6ZRP5	223 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SF3A3-208	ENST00000489537	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537		A0A1B0GW54	56 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537		A0A087WYN8	130 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537		Q6Q795	121 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	CCK	P06307	115 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	SPRR1A	P35321	89 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537		Q6ZQY7	126 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537		Q6ZRX8	168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537		H0Y9J4	135 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537		Q8NDZ9	215 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SF3A3-208	ENST00000489537	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3A3-208	ENST00000489537		Q6ZR54	194 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3A3-208	ENST00000489537		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3A3-208	ENST00000489537	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3A3-208	ENST00000489537	RYR1	P21817	5038 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SF3A3-208	ENST00000489537		B5MCH6	92 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SF3A3-208	ENST00000489537	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SF3A3-208	ENST00000489537	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms