RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 NUP35Q8NFH5 326 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00526Q96FQ7 95 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 AP1S3Q96PC3 154 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 DERL1Q9BUN8 251 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 GTSF1LQ9H1H1 148 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 DPH3P1Q9H4G8 78 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM17P0DL12 118 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 S100A4P26447 101 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB4BP61018 213 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 RHOHQ15669 191 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ADIRFQ15847 76 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 SPANXN1Q5VSR9 72 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2D3Q8NGH3 330 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TIMM21Q9BVV7 248 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf196B1AJZ1 125 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 M0QY20 66 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ARMS2P0C7Q2 107 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2D3P61077 147 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2D2P62837 147 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 GNG5P63218 68 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 SEC11AP67812 179 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 FABP9Q0Z7S8 132 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 SFTA2Q6UW10 78 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 LYZL1Q6UWQ5 148 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 NIT2Q9NQR4 276 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 MDN1Q9NU22 5596 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GV50 99 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BVH4 76 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 I3L3M4 83 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2BKO60814 126 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TRGC2P03986 189 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2BJP06899 126 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00614P0C842 121 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 GZMBP10144 247 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2BOP23527 126 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 CKS2P33552 79 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2BBP33778 126 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2BDP58876 126 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2BCP62807 126 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST2H2BEQ16778 126 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 IQCJQ1A5X6 159 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 BOD1L2Q8IYS8 172 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 Q8N8P6 123 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10AG1Q8NH19 301 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 C18orf32Q8TCD1 76 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2BHQ93079 126 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM141Q96I45 108 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2BNQ99877 126 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2BMQ99879 126 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 PRADC1Q9BSG0 188 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM2Q9BVW6 85 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP1LC3AQ9H492 121 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 SPANXA1Q9NS26 97 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HSPB8Q9UJY1 196 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 C20orf202A1L168 122 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 D6R8Y8 96 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 HBDP02042 147 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 MT1FP04733 61 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 S100A6P06703 90 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM6P0DI80 62 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 PLNP26678 52 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 FCER1GP30273 86 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 COTL1Q14019 142 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 SS18Q15532 418 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 PMCHL1Q16048 86 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TPRXLQ17RH7 258 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00269Q8N2A0 174 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TOMM6Q96B49 74 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 PRELID3AQ96N28 172 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ST20Q9HBF5 79 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 PKIGQ9Y2B9 76 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms