RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 UBA52P62987 128 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS13CQ709C8 3753 aa1.84□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 TANC1Q9C0D5 1861 aa1.84□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 MXRA5Q9NR99 2828 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAPPC2P0DI81 140 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAPPC2BP0DI82 140 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 MYO7AQ13402 2215 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 DOT1LQ8TEK3 1739 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV22A0A0B4J277 110 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC11AP67812 179 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 V9GYS6 101 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 PPLO60437 1756 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 MYH4Q9Y623 1939 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 ZANQ9Y493 2812 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA1109Q2LD37 5005 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF831Q5JPB2 1677 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM170BQ5T4T1 132 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZRX8 168 aa1.81□□□□□ -2.12
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RABGGTB-209ENST00000473406 Q9H521 79 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 PRO1854Q9UHT4 67 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 BSNQ9UPA5 3926 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 TENM2Q9NT68 2774 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLC7A0M8Q6 106 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 F8VRH5 84 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2D3P61077 147 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2D2P62837 147 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 PKDREJQ9NTG1 2253 aa1.8□□□□□ -2.12
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RABGGTB-209ENST00000473406 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 LCN9Q8WX39 176 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 AMELXQ99217 191 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 PMCHL2Q9BQD1 86 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 VAMP8Q9BV40 100 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 HYDINQ4G0P3 5121 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-209ENST00000473406 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
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RABGGTB-209ENST00000473406 GCHFRP30047 84 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-209ENST00000473406 CFAP126Q5VTH2 177 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM4Q8WVI0 70 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR15LQ9BU68 103 aa1.77□□□□□ -2.13
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RABGGTB-209ENST00000473406 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa1.76□□□□□ -2.13
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RABGGTB-209ENST00000473406 H3BQF6 201 aa1.74□□□□□ -2.13
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RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFC1O43677 76 aa1.74□□□□□ -2.13
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RABGGTB-209ENST00000473406 HMGN3Q15651 99 aa1.74□□□□□ -2.13
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RABGGTB-209ENST00000473406 ANKARQ7Z5J8 1434 aa1.74□□□□□ -2.13
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RABGGTB-209ENST00000473406 GNGT1P63211 74 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-209ENST00000473406 RYR2Q92736 4967 aa1.73□□□□□ -2.13
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC730098B7Z3J9 87 aa1.72□□□□□ -2.13
RABGGTB-209ENST00000473406 G3V318 75 aa1.72□□□□□ -2.13
RABGGTB-209ENST00000473406 PDCD5O14737 125 aa1.72□□□□□ -2.13
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RABGGTB-209ENST00000473406 RABAC1Q9UI14 185 aa1.72□□□□□ -2.13
RABGGTB-209ENST00000473406 COL7A1Q02388 2944 aa1.72□□□□□ -2.13
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RABGGTB-209ENST00000473406 SMCO4Q9NRQ5 59 aa1.71□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 DUOX1Q9NRD9 1551 aa1.71□□□□□ -2.14
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RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GUL6 1792 aa1.7□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 STAB2Q8WWQ8 2551 aa1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLC1P0CG04 106 aa1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PYY3Q5JQD4 70 aa1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM223AQ8IWN6 122 aa1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 SERP2Q8N6R1 65 aa1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PLIN4Q96Q06 1357 aa1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 HERC1Q15751 4861 aa1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CADP27708 2225 aa1.68□□□□□ -2.14
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