RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A087X002 238 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC3-206ENST00000469757 B5MCH6 92 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC3-206ENST00000469757 DLEU1O43261 78 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC3-206ENST00000469757 SCGB1D1O95968 90 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC3-206ENST00000469757 COX8AP10176 69 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC3-206ENST00000469757 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC3-206ENST00000469757 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC3-206ENST00000469757 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC3-206ENST00000469757 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
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TRAPPC3-206ENST00000469757 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC00483Q53H64 154 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPRR4Q96PI1 79 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q9BRP9 147 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 VAMP8Q9BV40 100 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
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TRAPPC3-206ENST00000469757 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 HIGD1BQ9P298 99 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 CTAG1AP78358 180 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPATA45Q537H7 98 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 ERC2-IT1O76042 136 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 A4D1N5 150 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 C6orf99Q4VX62 202 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1B0GWB2 263 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPRR1BP22528 89 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 COX7BP24311 80 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 C14orf144Q96I85 54 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC3-206ENST00000469757 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 HIST1H4GQ99525 98 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 A6NDN8 102 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 TAL2Q16559 108 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A0B4J2C4 111 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 CFC1BP0CG36 223 aa4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 CFC1P0CG37 223 aa4.79□□□□□ -1.64
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q8NBF4 154 aa4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 C12orf57Q99622 126 aa4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
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TRAPPC3-206ENST00000469757 A6NJY4 79 aa4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 SMIM6P0DI80 62 aa4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 HSD52Q0P140 79 aa4.78□□□□□ -1.64
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC3-206ENST00000469757 CEND1Q8N111 149 aa4.78□□□□□ -1.64
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TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC00575Q6W349 94 aa4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.76□□□□□ -1.65
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SPINK1P00995 79 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 TSPAN13O95857 204 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 VAMP3Q15836 100 aa4.75□□□□□ -1.65
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TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB37Q96AX2 223 aa4.75□□□□□ -1.65
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC25A20O43772 301 aa4.74□□□□□ -1.65
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TRAPPC3-206ENST00000469757 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 hADV29S1A0JD25 119 aa4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q6ZQY7 126 aa4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q8N377 158 aa4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1B0GX51 115 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC3-206ENST00000469757 H0YGX0 51 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC3-206ENST00000469757 H7C2G1 150 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC3-206ENST00000469757 CD164Q04900 197 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRR4Q16378 134 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC3-206ENST00000469757 TPRXLQ17RH7 258 aa4.71□□□□□ -1.66
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