RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 DNAH3Q8TD57 4116 aa10.24□□□□□ -0.77
SUCLG2-202ENST00000460567 F8P00451 2351 aa10.23□□□□□ -0.77
SUCLG2-202ENST00000460567 Q6ZVQ6 151 aa10.22□□□□□ -0.77
SUCLG2-202ENST00000460567 SPRR1AP35321 89 aa10.21□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa10.2□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.2□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A087WVE0 104 aa10.19□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 Q6ZRX8 168 aa10.19□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 PKIGQ9Y2B9 76 aa10.19□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.19□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.18□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 HAMPP81172 84 aa10.17□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 C14orf177Q52M58 125 aa10.17□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.16□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SUCLG2-202ENST00000460567 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa10.14□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM258P61165 79 aa10.12□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 Q8N377 158 aa10.12□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.11□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 M0R2N4 97 aa10.11□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 CASC10Q5T4H9 136 aa10.1□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 C16orf90A8MZG2 172 aa10.09□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 NREPQ16612 68 aa10.09□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE2CQ5TA81 110 aa10.09□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa10.09□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 REG3GQ6UW15 175 aa10.09□□□□□ -0.79
SUCLG2-202ENST00000460567 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.08□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 PSCAO43653 123 aa10.08□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 B9D2Q9BPU9 175 aa10.07□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 Q9BRP9 147 aa10.07□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 APLNQ9ULZ1 77 aa10.07□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM168BA1KXE4 195 aa10.06□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 DEFB105AQ8NG35 78 aa10.06□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 MAST4O15021 2626 aa10.06□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 TNP2Q05952 138 aa10.05□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 ANK2Q01484 3957 aa10.05□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.05□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 UBE2BP63146 152 aa10.04□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 TENM3Q9P273 2699 aa10.02□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.02□□□□□ -0.8
SUCLG2-202ENST00000460567 BPY2O14599 106 aa10.02□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 C1orf137Q5JT78 98 aa10.02□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 NUPR2A6NF83 97 aa10.01□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 F8WEM9 126 aa10.01□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 Q8NBF4 154 aa10.01□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 SPRR4Q96PI1 79 aa10.01□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 J3KT08 172 aa10.01□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 ERC2-IT1O76042 136 aa10.01□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC00474Q9P2X8 69 aa10.01□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 STAB1Q9NY15 2570 aa10□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 DNAH1Q9P2D7 4330 aa10□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 H0Y9J4 135 aa9.99□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A096LNI7 61 aa9.98□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.98□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 NDUFC1O43677 76 aa9.97□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 KLKP1Q107X0 134 aa9.97□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.97□□□□□ -0.81
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A1W2PNM2 257 aa9.96□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 IGKV4-1P06312 121 aa9.96□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.95□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 C3orf84H3BNL1 204 aa9.95□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 C20orf197Q8N268 126 aa9.95□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.95□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.94□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.93□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 SCXQ7RTU7 201 aa9.93□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.92□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 SMIM29Q86T20 159 aa9.92□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.91□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A1W2PNN7 141 aa9.91□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa9.91□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 SPRR1BP22528 89 aa9.9□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 DPH3Q96FX2 82 aa9.9□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.9□□□□□ -0.82
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.89□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.88□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa9.86□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM236CP0DP71 79 aa9.86□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 MDFIQ99750 246 aa9.86□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 H7BZZ5 65 aa9.85□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 UBE2AP49459 152 aa9.85□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.84□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 OCR1Q9BZK8 76 aa9.84□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 PRLHP81277 87 aa9.84□□□□□ -0.83
SUCLG2-202ENST00000460567 IGFL1Q6UW32 110 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms