RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391087.1

RNU6-1275P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1275, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1275P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CALML5Q9NZT1 146 aa-6.77□□□□□ -3.49
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C20orf202A1L168 122 aa-6.78□□□□□ -3.49
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NDUFC1O43677 76 aa-6.78□□□□□ -3.49
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DPM2O94777 84 aa-6.78□□□□□ -3.49
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LEPROTL1O95214 131 aa-6.78□□□□□ -3.49
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SFTA2Q6UW10 78 aa-6.78□□□□□ -3.49
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CD163L1Q9NR16 1453 aa-6.79□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-6.79□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-6.79□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-6.79□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TNFSF15O95150 251 aa-6.79□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CFAP53Q96M91 514 aa-6.79□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BRCA2P51587 3418 aa-6.79□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C7orf77A4D0Y5 90 aa-6.8□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IGLC2P0DOY2 106 aa-6.8□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IGLC3P0DOY3 106 aa-6.8□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MNS1Q8NEH6 495 aa-6.8□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ARL11Q969Q4 196 aa-6.8□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 M0R129 80 aa-6.81□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-6.81□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-6.81□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SS18L2Q9UHA2 77 aa-6.81□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-6.81□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DEXIO95424 95 aa-6.82□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-6.82□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TOP2BQ02880 1626 aa-6.83□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C9orf16Q9BUW7 83 aa-6.83□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-6.84□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MT-ND4LP03901 98 aa-6.84□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 VPS13AQ96RL7 3174 aa-6.84□□□□□ -3.5
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SPEF2Q9C093 1822 aa-6.85□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PAEPP09466 180 aa-6.85□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRAPPC2P0DI81 140 aa-6.85□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-6.85□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-6.85□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DYDC1Q8WWB3 177 aa-6.85□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC115Q96NT0 180 aa-6.85□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-6.87□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC172P0C7W6 258 aa-6.87□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 THEM6Q8WUY1 208 aa-6.87□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATG12O94817 140 aa-6.88□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 COX6CP09669 75 aa-6.88□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP-6.88□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 REEP5Q00765 189 aa-6.88□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TCTE3Q8IZS6 198 aa-6.88□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-6.88□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-6.89□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RGS21Q2M5E4 152 aa-6.89□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM244Q5VVB8 128 aa-6.89□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM24BQ8N5W8 94 aa-6.9□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-6.9□□□□□ -3.51
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-6.91□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C12orf57Q99622 126 aa-6.91□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP-6.91□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 VAMP8Q9BV40 100 aa-6.91□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-6.92□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SCAPERQ9BY12 1400 aa-6.92□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ITSN1Q15811 1721 aa-6.92□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LINC00474Q9P2X8 69 aa-6.92□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 XIRP2A4UGR9 3374 aa-6.92□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NCS1P62166 190 aa-6.93□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TCEAL4Q96EI5 215 aa-6.93□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-6.93□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-6.94□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RGPD1P0DJD0 1748 aa-6.94□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-6.95□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C12orf73Q69YU5 71 aa-6.95□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GAFA1Q96PS6 74 aa-6.95□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC32Q9BV29 185 aa-6.95□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MANBALQ9NQG1 85 aa-6.95□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-6.96□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SMIM23A6NLE4 172 aa-6.96□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SFTA3P0C7M3 94 aa-6.96□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 Q56UQ5 140 aa-6.96□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-6.96□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SPANXDQ9BXN6 97 aa-6.96□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-6.96□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KIF14Q15058 1648 aa-6.97□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PREX2Q70Z35 1606 aa-6.97□□□□□ -3.52
RNU6-1275P-201ENST00000391087 Q0VG73 95 aa-6.97□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC58Q4VC31 144 aa-6.97□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP-6.97□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR13C6PQ8NH95 151 aa-6.97□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM9CQ8IZT9 166 aa-6.98□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-6.98□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PRO1854Q9UHT4 67 aa-6.98□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CLASP1Q7Z460 1538 aa-6.98□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KCNRGQ8N5I3 272 aa-7□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-7□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC42Q96M95 316 aa-7□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 F6UZH7 168 aa-7.01□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-7.01□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-7.02□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TJP1Q07157 1748 aa-7.02□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-7.03□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DBIP07108 87 aaKnown RBP-7.03□□□□□ -3.53
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PPLO60437 1756 aa-7.03□□□□□ -3.54
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CHD1O14646 1710 aa-7.04□□□□□ -3.54
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TSTD3H0UI37 97 aa-7.04□□□□□ -3.54
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-7.04□□□□□ -3.54
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