RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CST11Q9H112 138 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSMD11O00231 422 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TNFAIP8O95379 198 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HSD11B1P28845 292 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GNGT1P63211 74 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSNQ15631 228 aaKnown RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2orf76Q3KRA6 126 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC122Q5T0U0 273 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 S100A7AQ86SG5 101 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM203Q969S6 136 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANP32EQ9BTT0 268 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COA1Q9GZY4 146 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARMC7Q9H6L4 198 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMBIM4Q9HC24 238 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1B0GW54 56 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SYCE3A1L190 88 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DISC1C4P0D8 188 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H3BQF6 201 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NCS1P62166 190 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 USE1Q9NZ43 259 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COMMD9Q9P000 198 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HBDP02042 147 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAB11BQ15907 218 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 S100A7L2Q5SY68 101 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPATA24Q86W54 205 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HPCAL4Q9UM19 191 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LENEPQ9Y5L5 61 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARL5CA6NH57 179 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDCD5O14737 125 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CETN3O15182 167 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SKP1P63208 163 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HBBP68871 147 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC153Q494R4 210 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLVS2Q5SYC1 327 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TEX37Q96LM6 180 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FABP1P07148 127 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGLC2P0DOY2 106 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGLC3P0DOY3 106 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYL2P10916 166 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SYPL2Q5VXT5 272 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C10orf53Q8N6V4 93 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC35B4Q969S0 331 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GAFA1Q96PS6 74 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 M0QZ92 97 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UQCRHP07919 91 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNE1P15382 129 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP6V1C1P21283 382 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD9P21926 228 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLGLB1Q02325 96 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMCO1Q147U7 214 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LSMEM1Q8N8F7 131 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARL11Q969Q4 196 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DRC3Q9H069 523 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HPF1Q9NWY4 346 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1B0GWA3 101 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 E7EQ34 232 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NDUFB3O43676 98 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FABP5Q01469 135 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPRMQ9NS64 109 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1B0GV72 72 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BIRC5O15392 142 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNCGO76070 127 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GCGP01275 180 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 S100A10P60903 97 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BST2Q10589 180 aaKnown RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM133Q9H2Q1 129 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM216Q9P0N5 145 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CFL2Q9Y281 166 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PYDC1Q8WXC3 89 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POLE3Q9NRF9 147 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GSKIPQ9P0R6 139 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FTCDNL1E5RQL4 147 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NDUFA2O43678 99 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CALB1P05937 261 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBP2P50120 134 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DSTNP60981 165 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCP4L1A6NKN8 68 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNAPC5O75971 98 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NREPQ16612 68 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM228AQ86W67 206 aa-3.98□□□□□ -3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.8 ms